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2023年生物科技最值得關(guān)注的“十大前沿創(chuàng)新”

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2023年生物科技最值得關(guān)注的“十大前沿創(chuàng)新”

2023年最值得關(guān)注的“十大前沿創(chuàng)新”

文|動脈網(wǎng)

在過去一年中,橙果局訪問了近百位科學(xué)家,數(shù)十位創(chuàng)業(yè)者和投資人。在與他們的交流中,我們反復(fù)的去討論同一個話題,未來的創(chuàng)新在哪里?通過與這些人的交流,以及對產(chǎn)業(yè)的觀察,我們堅信未來的創(chuàng)新將有技術(shù)引領(lǐng)。

未來屬于哪些技術(shù)呢?是頗具科幻概念的量子計算,還是各國戰(zhàn)略布局的重點的腦科學(xué),又或者是被《Nature》譽為“生命科學(xué)”的下一個風(fēng)口的空間組學(xué)?

辭舊迎新,正是各類榜單集中發(fā)布的時候。作為關(guān)注前沿創(chuàng)新與成果轉(zhuǎn)化的垂直媒體,在大量訪談、調(diào)研和資料收集后,關(guān)于未來創(chuàng)新的技術(shù)猜想,橙果局也有一份清單要與你分享。Shall we?

量子計算

2022年諾貝爾物理學(xué)獎授予奠定量子計算基礎(chǔ)的科學(xué)家Alain Aspect、John Clauser和Anton Zeilinger,他們因詳細描述了量子糾纏而獲得物理學(xué)最高榮譽。三位科學(xué)家彌合了理論與實際應(yīng)用之間的鴻溝,也為當(dāng)今的量子計算行業(yè)鋪平了道路。

本質(zhì)上,量子計算是一種新型計算模式,遵循量子力學(xué)規(guī)律。對照于傳統(tǒng)的通用計算機,其理論模型是用量子力學(xué)規(guī)律重新詮釋的通用圖靈機。從可計算的問題來看,量子計算機只能解決傳統(tǒng)計算機所能解決的問題,但是從計算的效率上,由于量子力學(xué)疊加性的存在,某些已知的量子算法在處理問題時速度要快于傳統(tǒng)的通用計算機。

潘建偉院士曾指出,量子計算是基于量子力學(xué)的全新計算模式,具有原理上遠超經(jīng)典計算的強大并行計算能力,為人工智能、密碼分析、氣象預(yù)報、資源勘探、藥物設(shè)計等所需的大規(guī)模計算難題提供了解決方案,并可揭示量子相變、高溫超導(dǎo)、量子霍爾效應(yīng)等復(fù)雜物理機制。

2019年,谷歌宣稱實現(xiàn)了“量子霸權(quán)”,并登上了《Nature》雜志封面。這項技術(shù)將如何對醫(yī)療保健部門產(chǎn)生重大影響,將醫(yī)療決策推向了全新的水平。

量子計算在醫(yī)療保健中的應(yīng)用非常多,覆蓋藥物設(shè)計、臨床診斷、生物信息、醫(yī)療大數(shù)據(jù)等方面,量子計算正以更快的決策、更安全的數(shù)據(jù)保護、更便宜高校的數(shù)據(jù)分析影響著醫(yī)療與創(chuàng)新。

■ 靶點的識別和分析

結(jié)合現(xiàn)在藥物研發(fā)的流程,量子計算在藥物發(fā)現(xiàn)的降本增效上展現(xiàn)出潛力和價值。靶點是指藥物進入人體后同生物大分子結(jié)合的部位,靶點類型包括受體、酶、離子通道等生物大分子,是藥物研發(fā)的起點。

靶點的識別主要有兩種思路:一是對有豐富實驗數(shù)據(jù)的大分子進行晶體結(jié)構(gòu)分析;二是先進行分子結(jié)構(gòu)的預(yù)測再進行實驗分析。無論哪種方式,都繞不開分子結(jié)構(gòu)的預(yù)測。無論是CADD還是AIDD,如果沒有算力和數(shù)據(jù)的支撐都很難實現(xiàn)動態(tài)和精準(zhǔn)的結(jié)構(gòu)預(yù)測。

而量子計算的出現(xiàn)則有望實現(xiàn)靶點識別的加速。如蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)預(yù)測,量子計算可以通過模擬氨基酸、分子間的相互作用從而得到精準(zhǔn)靶點對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測。D-Wave、ProteinQure等很多家初創(chuàng)公司在探索。

■ 候選化合物篩選

藥物篩選是發(fā)現(xiàn)先到化合物的必須路徑,通過對化合物的生物活性、藥理、毒理的評估,預(yù)測化合物成效的可能性和價值。目前藥物篩選的方式有兩種,一是基于高通量的試驗篩選,二是基于計算機模型的虛擬篩選。

虛擬篩選是藥物篩選的發(fā)展趨勢,但對于缺乏實驗數(shù)據(jù)的化合物和高精度算法,目前能夠發(fā)揮的價值有限。而量子計算在精準(zhǔn)性和速度上都更有優(yōu)勢,在藥物篩選上也具備發(fā)展前景。目前已經(jīng)有多家藥企開始了探索,如羅氏與劍橋量子計算在2021年的合作,目的就是探索量子計算在化合物篩選上的潛力,并希望以此再度挑戰(zhàn)阿爾茲海默癥。

■ 化合物優(yōu)化

候選化合物并不意味著它就具備了成效能力,或多或少,這些化合物都存在缺陷,如毒副作用大、活性不高等問題。因此,真毒篩選出的候選化合物,還需要對化合物進行優(yōu)化,以獲得有可能成藥的化合物分子。

化合物結(jié)構(gòu)的優(yōu)化首先要了解化合物的結(jié)構(gòu),其次還需要對調(diào)整后的化合物特性做出預(yù)判。無疑,這也可能是量子計算的主場——化合物結(jié)構(gòu)調(diào)整遵循量子力學(xué)。這一方面,谷歌的量子計算團隊已經(jīng)進行了探索,谷歌的量子計算機在2020年登上《Science》封面,主要成果就是用12個量子比特模擬了二氮烯的異構(gòu)化反應(yīng)。

■ 臨床診斷

在臨床診斷中,量子計算也具有非常大的應(yīng)用潛力。

一方面是量子計算與成像技術(shù)的結(jié)合。磁共振指紋(MRF)是一種基于量子計算的新技術(shù),可以在較短的掃描時間內(nèi)同時量化多種組織特性。2018NIAN ,微軟與Case Western Reserve大學(xué)的研究人員合作開發(fā)了一種磁共振指紋(MRF)技術(shù),研究人員將先進的量子計算計算用于創(chuàng)造更高質(zhì)量的成像技術(shù),并利用HoloLens增強現(xiàn)實平臺將3D影像展示給醫(yī)生?;谠撈脚_,醫(yī)生能夠能夠?qū)崿F(xiàn)癌癥患者單次化療之后的療效。

量子計算機與機器學(xué)習(xí)相結(jié)合,將用于醫(yī)學(xué)診斷和概率推理也是一個方向。劍橋量子計算(CQC)的科學(xué)家開發(fā)出一種方法,證明了量子機器可以從非常普遍的概率推理模型中推斷出隱藏信息。這些方法可以改善很多應(yīng)用,包括復(fù)雜系統(tǒng)中的推理和量化不確定性。例如在醫(yī)療診斷,關(guān)鍵任務(wù)機器中的故障檢測或投資管理的財務(wù)預(yù)測。

此外,量子計算還可以較容易的對復(fù)雜高緯度的數(shù)據(jù)進行整理,適用于核磁共振、血管造影的診斷技術(shù)的智能化。

■ 大數(shù)據(jù)與生物信息

既然是計算,那么量子計算技術(shù)與生物信息勢必會有好故事可以說。

量子計算可以高效地產(chǎn)生復(fù)雜的數(shù)據(jù)分布,在基因序列的排列、對比和組裝等過程中都能夠發(fā)揮作用,通過近似優(yōu)化算法減少計算量,縮短計算時間。而對于多組學(xué)數(shù)據(jù)的整合,量子計算也可以比經(jīng)典計算方法更快、更精準(zhǔn)的從復(fù)雜數(shù)據(jù)分布中尋找到模型和規(guī)律。這也為醫(yī)療大數(shù)據(jù)的應(yīng)用提供了契機。

除了數(shù)據(jù)存儲、結(jié)構(gòu)化以外,大數(shù)據(jù)的應(yīng)用還有運算。而隨著多組學(xué)的發(fā)展,醫(yī)療大數(shù)據(jù)已經(jīng)遠不能用海量來形容,數(shù)據(jù)和臨床表型的聯(lián)系也復(fù)雜而多樣。這是現(xiàn)有的計算能力無法勝任的,需要有更強算力、更快計算速度、更深層次數(shù)據(jù)處理能力的計算方法支持。量子計算或許就是幫助人們從大量非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)中尋找答案的利器。

■ 醫(yī)療保健

承接上文,量子計算能夠從海量數(shù)據(jù)中尋找規(guī)律,或使數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)化。那么這些數(shù)據(jù)可以干什么?或許有一個答案呼之欲出——個性化的醫(yī)療或者健康管理。

筆者想到了一家美國的醫(yī)療保健公司Human Longevity,這家公司最早由Craig Venter創(chuàng)立。我們先不談公司和Craig Venter之間的愛恨糾葛,來看看他的商業(yè)邏輯:

最早Human Longevity希望利用基因組學(xué)、干細胞技術(shù)、大數(shù)據(jù)、人工智能等新技術(shù),找到人類衰老的根源,以及隨之而來的疾病的內(nèi)在原因,并發(fā)現(xiàn)相應(yīng)的藥物或療法,以撥慢老去的時鐘。但經(jīng)過多難的發(fā)展,這樣理想始終難以實現(xiàn),而讓Human Longevity真正實現(xiàn)引領(lǐng)的,其實是基于基因測序等臨床診斷技術(shù)的高端體檢和健康管理業(yè)務(wù)。

基于Human Longevity有兩點值得想象,其一是基于多組學(xué)的健康管理是一個可以成立的商業(yè)邏輯;其二則是基于多組學(xué)技術(shù)進行藥物或者療法研發(fā)的商業(yè)邏輯是否能夠通過量子計算補齊?

換而言之,量子計算的除了能力為醫(yī)療保健和藥物研發(fā)都提供了新的路徑。如果基于量子計算,海量的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)能夠得以應(yīng)用,或許能夠為臨床診療、健康管理和藥物研發(fā)都帶來新的體驗。也正式如此,盡管某些應(yīng)用還處于暢想階段,仍有無數(shù)的研究人員、科技巨頭和初創(chuàng)公司為之奔赴。

中國成了目前世界上唯一在兩種物理體系達到“量子計算優(yōu)越性”里程碑的國家?;A(chǔ)研究上,中國量子物理研究水平居世界前列,兩項項成果入選國際物理學(xué)領(lǐng)域“十強”。產(chǎn)業(yè)端,無論是量子計算還是產(chǎn)業(yè)應(yīng)用,國內(nèi)都已經(jīng)開始,并已獲得資本與產(chǎn)業(yè)共同關(guān)注。盡管在具體應(yīng)用比美國稍微滯后,但基礎(chǔ)研究的底蘊和市場需求下,中國的量子計算或許有無限可能。

再生醫(yī)學(xué)研究

器官能夠再生、人體能夠長生不老……再生醫(yī)學(xué)讓以往出現(xiàn)在科幻片中的情節(jié)有機會成為現(xiàn)實。再生醫(yī)學(xué)是指利用生物學(xué)及工程學(xué)的理論方法創(chuàng)造丟失或功能損害的組織和器官,促進機體自我修復(fù)和再生,使其具備正常組織和器官的結(jié)構(gòu)和功能。除了目前已經(jīng)逐步實現(xiàn)的皮膚、組織再生,新材料、新技術(shù)的涌現(xiàn)讓更宏偉的“再生”成為可能。

■ 器官“再生”

生物再生材料具有優(yōu)異的組織誘導(dǎo)性,將生物再生材料植入人體,可誘導(dǎo)缺損組織和器官進行再生修復(fù),應(yīng)用于骨科、神經(jīng)外科、心血管、眼科、口腔、醫(yī)美等領(lǐng)域。在再生研究中,材料發(fā)揮的作用主要有兩個方面,其一是促進再生,其二則是為細胞的生長提供支撐。

目前已經(jīng)成功走向市場的生物再生材料/產(chǎn)品主要是針對成分和結(jié)構(gòu)相對簡單的皮膚、骨組織再生。一些新的跨界融合或許能夠?qū)崿F(xiàn)更為復(fù)雜組織的“再生“。比如一些自身無法再生的組織,如器官、已經(jīng)缺失的組織等,通過再生材料和干細胞進行結(jié)合,可在體外進行培養(yǎng)從而實現(xiàn)這些組織的再生。

帝國理工學(xué)院生物材料科學(xué)教授Molly Stevens曾在一次訪談中提到,她現(xiàn)在在全世界范圍內(nèi)有很多這樣的干細胞實驗,使用過很多不同種類的細胞,但似乎得到的都是同一個結(jié)果——這些細胞一旦移植通常都會死掉。但如果能和材料結(jié)合,形成一個體內(nèi)生物反應(yīng)器,其生存率必然大大提高。四川大學(xué)解慧琪教授課題組研究了來自不同來源間充質(zhì)干細胞?;谀蛟葱愿杉毎芯繄F隊繼續(xù)針對腎臟、尿道、膀胱修復(fù)、心肌修復(fù)、食管修復(fù)和干細胞、軟骨關(guān)鍵修復(fù)等做了大量研究。

基于材料疊加干細胞的再生醫(yī)學(xué)研究,正在成為再生醫(yī)學(xué)研究的未來趨勢?;谶@樣的思路,或許器官再生的未來不遠。

■ 衰老相關(guān)疾病治療

除了創(chuàng)傷,衰老也會給細胞和器官、組織帶來損傷。這個過程是長期進行且不可逆的。細胞進入衰老階段后回表現(xiàn)出不可逆的、抗凋亡的有絲分裂停滯狀態(tài),導(dǎo)致它們在基因表達、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和細胞行為上發(fā)生功能改變。而在人的層面,則表現(xiàn)為器官功能下降,以及某些疾病的發(fā)生。

人們曾癡迷尋找長生的答案,卻發(fā)現(xiàn)隨著壽命的延長,衰老本身就成為了生命健康的風(fēng)險?,F(xiàn)如今,人口老齡化將成為世界的經(jīng)濟增長和可持續(xù)性發(fā)展的重大威脅。距離人們首次證明了衰老過程是可塑的已經(jīng)近百年,限制熱量、清除衰老細胞、干細胞療法、微生物治療.......各類研究百花齊放。盡管人口老齡化問題仍在加劇,但隨著對衰老的深入了解,延緩衰老將漸行漸近。

不可回避的是,中國再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的發(fā)展仍舊處于極早期。骨修復(fù)、再生醫(yī)美、口腔修復(fù)等產(chǎn)品已經(jīng)實現(xiàn)商業(yè)化,再生器官等高技術(shù)壁壘的產(chǎn)品還停留在科研層面,據(jù)悉,再生腎臟、再生心臟在全球范圍內(nèi)都沒有產(chǎn)品進入臨床。發(fā)展,除了基礎(chǔ)研究和應(yīng)用研究的突破以外,產(chǎn)業(yè)化還需要監(jiān)管、資本和上下游的協(xié)同發(fā)力。

數(shù)字技術(shù)

數(shù)字技術(shù)是與電子計算機相伴相生的科學(xué)技術(shù),它是指借助一定的設(shè)備將各種信息,包括:圖、文、聲、像等,轉(zhuǎn)化為電子計算機能識別的二進制數(shù)字“0”和“1”后進行運算、加工、存儲、傳送、傳播、還原的技術(shù)。

將數(shù)字技術(shù)與醫(yī)療過程結(jié)合誕生了數(shù)字醫(yī)療,數(shù)字醫(yī)療設(shè)備、數(shù)字療法的出現(xiàn),極大地豐富了臨床的診療。通過醫(yī)療信息化產(chǎn)生的數(shù)據(jù)積累,互聯(lián)網(wǎng)醫(yī)療的交互形式,以及AI、3D打印等新型技術(shù)的發(fā)展,數(shù)字醫(yī)療正在孕育一個新的業(yè)務(wù)形態(tài)。

■ 數(shù)字醫(yī)療設(shè)備

醫(yī)療的數(shù)字化,首先是診療設(shè)備的數(shù)字化,這是數(shù)字化醫(yī)療的基礎(chǔ)。所謂數(shù)字化的醫(yī)療設(shè)備,指的是以計算機技術(shù)為基礎(chǔ),信號采集和功率輸入盡量靠近前端,控制、數(shù)據(jù)采集、處理、存儲與傳輸、執(zhí)行等過程信息均實現(xiàn)數(shù)字化。另外,數(shù)字化的醫(yī)療設(shè)備具有更為清晰的圖像和更為精確地量化衡量方式,為醫(yī)生進行更為精確的診斷提供物質(zhì)和技術(shù)保障。在計算機軟件下工作的醫(yī)療設(shè)備,已逐漸取代常規(guī)設(shè)備成為臨床設(shè)備的主流。

數(shù)字醫(yī)療設(shè)備的出現(xiàn),大大豐富了醫(yī)學(xué)信息的內(nèi)涵和容量。如心電(ECG)和腦電(EEG)等電生理信息的可視化,CT、MRI等影像的三維、四維可視化,數(shù)字技術(shù)與醫(yī)療的結(jié)合正在為臨床科室?guī)砣碌捏w驗。

可視化是數(shù)字醫(yī)療設(shè)備的主要方向,因此,數(shù)字化成像設(shè)備是數(shù)字醫(yī)療設(shè)備的重要部分。大多數(shù)此類設(shè)備可以直接從數(shù)字接口采集圖像。目前這些設(shè)備的接口也正在區(qū)域標(biāo)準(zhǔn)化,無論是實際圖像還是模擬圖像,接口都已經(jīng)有相應(yīng)的規(guī)定和標(biāo)準(zhǔn)。

此外,通過多學(xué)科先進技術(shù)的融合,數(shù)字醫(yī)療設(shè)備往往能夠呈現(xiàn)深層、高清的圖像,是的病癥、病灶和病理的確認時間提前、結(jié)果更清晰和精準(zhǔn),也極大的提高了臨床診療的效率和質(zhì)量。

當(dāng)然,除了可視化以外,網(wǎng)絡(luò)化、智能化趨勢也清晰可見。

■ 醫(yī)院管理

長期以來,醫(yī)院一直在尋找安全、高效而便捷的管理方案。數(shù)據(jù)管理一直是醫(yī)院管理的難題,數(shù)據(jù)質(zhì)量需要保持準(zhǔn)確性、一致性和及時性,底層數(shù)據(jù)的采集與互聯(lián)需要及時、準(zhǔn)確而高校,數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)化需要深度智能化......這些都有望通過數(shù)字化的醫(yī)院管理創(chuàng)新實現(xiàn)。

管理者可以通過網(wǎng)絡(luò)隨時了解醫(yī)院的運營情況及各部門的工作情況,使醫(yī)院始終處于最佳運行狀態(tài)。而且,醫(yī)院可以隨時為病人提供各種所需的診療信息。同時,基于對底層數(shù)據(jù)的感知,數(shù)字化管理系統(tǒng)可以為醫(yī)院提供個性化的、符合醫(yī)院實際情況的管理方案。具體包括醫(yī)院績效、醫(yī)生管理、病案管理、醫(yī)院設(shè)備管理等等。

■ 醫(yī)療支付

隨著數(shù)字技術(shù)與醫(yī)療場景深度融合,新技術(shù)、新支付已成為擴大優(yōu)質(zhì)醫(yī)療服務(wù)供給的內(nèi)生動力,“醫(yī)療+藥(械)+保險”的創(chuàng)新融合正惠及越來越多的患者。醫(yī)療支付體系正在發(fā)生變革,除了支付中心向患者集中外,商業(yè)險、養(yǎng)老及護理險亦展現(xiàn)出潛力。

隨著參保群體的擴大和數(shù)據(jù)的豐富,醫(yī)療支付可能會出現(xiàn)幾個變化,首先可能是保險的差異化,根據(jù)不同的群體(患者、健康群體)推出險種的差異化,或者根據(jù)不同群體在同一險種推出差異化保費;其次可能是數(shù)據(jù)的價值創(chuàng)造,基于健康數(shù)據(jù)庫進行的個性化健康管理方案開發(fā),亦或者是理賠數(shù)據(jù)的精確計算。

這些場景中都可能會出現(xiàn)數(shù)字化的身影。數(shù)字化醫(yī)療一方面可以解決傳統(tǒng)醫(yī)療體系應(yīng)用中的難題,另一方面則是支付效率的提升。

■ 藥械企業(yè)創(chuàng)新

除了面向臨床和消費端,數(shù)字技術(shù)在產(chǎn)品端也大有可為。

首先是研發(fā)場景,如同數(shù)字化對醫(yī)院和支付體系的管理,數(shù)字技術(shù)同樣可以賦能藥物和醫(yī)療器械的研發(fā),通過數(shù)字化平臺可以對藥物研發(fā)流程進行管理。其次,通過數(shù)字化方案對臨床數(shù)據(jù)進行挖掘和生物信息分析,相比傳統(tǒng)分析手段更有效率,更有可能基于數(shù)據(jù)挖掘?qū)崿F(xiàn)“老藥新用”。

其次是生產(chǎn)環(huán)節(jié),可以利用機器視覺替代檢測人員,不僅減少了在整個生產(chǎn)環(huán)節(jié)的人工成本,更提升了檢測的準(zhǔn)確率與效率。此類應(yīng)用已經(jīng)在部分企業(yè)率先落地。經(jīng)過簡單模型與復(fù)雜特征的多重訓(xùn)練后,機器視覺與人工標(biāo)注的一致率已經(jīng)高達98.879%。

最后是流通環(huán)節(jié),數(shù)據(jù)仍然蘊含著大量亟待挖掘的價值。例如與某些疾病關(guān)聯(lián)的藥品,在需求上可能帶有明顯的地域集中性和時間周期性。因此,大量的AI算法應(yīng)運而生,藥物需求的預(yù)測正在成為可能。藥物和器械流通行業(yè)的參與者們也得以乘上數(shù)字化轉(zhuǎn)型的東風(fēng),通過邊緣實時的計算進行更精準(zhǔn)的預(yù)測,從而制訂更科學(xué)合理的藥物銷售與存儲策略。

■ 數(shù)字療法

借助數(shù)字技術(shù),還有一個曾經(jīng)被認為是未來愿景的場景正在逐漸成為現(xiàn)實--現(xiàn)在,我們已經(jīng)可以根據(jù)醫(yī)生的處方下載一款 APP 用于疾病治療。APP 也將成為一種藥物形式,或單獨存在,或與傳統(tǒng)藥物相結(jié)合,帶來更高效、更普及的治療方式。這也就是目前全行業(yè)高度關(guān)注的“數(shù)字療法 。

數(shù)字療法是一種向患者提供的、基于循證醫(yī)學(xué)證據(jù)的治療措施或干預(yù)措施。這些干預(yù)措施由高質(zhì)量的軟件程序驅(qū)動,其本質(zhì)是服務(wù)的數(shù)字化,核心功能則是用于預(yù)防、管理或治療某種疾病。它們可以單獨使用,也可以與藥物、設(shè)備或其他療法協(xié)同使用。

目前大多數(shù)數(shù)字療法圍繞精神類疾病、慢病、心理疾病等需要強干預(yù)的疾病展開。相比傳統(tǒng)療法,數(shù)字療法可以遠程進行問診或治療,也可以診斷患者的時間和物理空間進行個性化定制,此外在成本上也低于傳統(tǒng)療法。

當(dāng)然,數(shù)字技術(shù)的價值還遠不止于此,它不僅改變改變臨床與產(chǎn)品研發(fā),也在給患者和消費群體帶來更舒適的體驗。人們可以在家中通過網(wǎng)絡(luò)預(yù)約掛號;人們不再需要在檢查室等候檢查結(jié)果,各種診療影像和數(shù)據(jù)可以通過網(wǎng)絡(luò)直接傳送到主治醫(yī)生的面前,醫(yī)生可以及時、準(zhǔn)確地對病人做出診治?;诨ヂ?lián)網(wǎng)、有線電視等私人醫(yī)療保健服務(wù)和公眾醫(yī)療咨詢服務(wù),將隨時提醒大眾進行身體檢查、預(yù)測某種疾病的發(fā)生和發(fā)展,向病人推薦新的治療方法,使病人可以足不出戶享受個人醫(yī)生的醫(yī)療保健服務(wù)。當(dāng)下數(shù)字醫(yī)療已經(jīng)前景到一定高度,并獲得廣泛關(guān)注,但一切其實正在開始,未來或許還會有更多驚喜。

腦機接口

腦機接口,有時也稱作“大腦端口“或者“腦機融合感知”。這里的“腦”指有機生命形式的腦或者神經(jīng)系統(tǒng),“機”意指任何處理或計算的設(shè)備,其形式可以從簡單電路到硅芯片。

腦機接口技術(shù)被稱作是人腦與外界溝通交流的“信息高速公路”,是公認的新一代人機交互和人機混合智能的關(guān)鍵核心技術(shù)。除了頗具科幻概念的“意念控制”以外,腦機接口在醫(yī)療領(lǐng)域比較清晰的應(yīng)用方向是運動神經(jīng)康復(fù)和神經(jīng)疾病治療。不同于以往的外骨骼輔助產(chǎn)品,基于腦機接口的神經(jīng)修復(fù)是目前可見的、真正意義上的“控制恢復(fù)”。

■ 神經(jīng)調(diào)控

神經(jīng)調(diào)控是腦機接口信號閉環(huán)中向大腦寫入信號的過程,通過不同類別信號的刺激,可以改善和治療一些神經(jīng)系統(tǒng)的疾病狀態(tài)。當(dāng)前,基于電、聲、光、磁刺激神經(jīng)調(diào)控的腦機接口已經(jīng)實現(xiàn)商業(yè)化,從人工耳蝸,到腦深部電刺激再到經(jīng)顱磁刺激和近紅外功能成像,未來可以期待擴展到其他疾病的改善或治療。

■ 運動康復(fù)

腦機接口技術(shù)能夠?qū)崟r檢測患者腦電狀態(tài),通過訓(xùn)練調(diào)控大腦信號,影響皮質(zhì)活動,從而使患者鍛煉大腦神經(jīng),提高其功能性和連接性,實現(xiàn)了患者“意念控制”下的主被動協(xié)同康復(fù)訓(xùn)練。打破了傳統(tǒng)康復(fù)方式被動且單一的問題,實現(xiàn)患者意念控制下的主動康復(fù),顯著提升康復(fù)治療效果。

■ 神經(jīng)義肢

通過人工智能算法處理神經(jīng)-肌肉信號并結(jié)合內(nèi)置傳感器識別用戶意圖,實現(xiàn)“心隨手動”及走路跑步隨意切換的狀態(tài),可為殘障人士創(chuàng)造高品質(zhì)生活。目前這一類產(chǎn)品多為非侵入性產(chǎn)品。隨著技術(shù)的成熟與發(fā)展,集成式的植入性產(chǎn)品正在走向現(xiàn)實,這些產(chǎn)品主要面向漸凍癥、高位截癱等嚴重損傷疾病,或許隨著日后技術(shù)和監(jiān)管體系的成熟,侵入性腦機接口產(chǎn)品會帶來更多可能。

中國腦計劃以腦認知的神經(jīng)基礎(chǔ)為主體,以腦疾病的診治及腦機智能技術(shù)為兩翼開展底層布局,從認識腦、保護腦、模擬腦三個方面開展腦科學(xué)與類腦研究,形成“一體兩翼”的完善戰(zhàn)略布局。

國家“十四五”規(guī)劃部署五項研究重點領(lǐng)域,其中腦機融合納入重點技術(shù)研究范疇;2021年,我國正式啟動了百億級的科技創(chuàng)新2030重大項目“腦科學(xué)與類腦研究”,當(dāng)前中國腦計劃研究已進入實際落地階段。

目前的腦機接口產(chǎn)品主要是以非侵入性為主,具體原因可能與技術(shù)成熟度、監(jiān)管審批和適應(yīng)癥需求程度有關(guān)。此外,腦部植入性材料對生物相容性、穩(wěn)定性要求較高,這些植入材料和芯片、零部件的發(fā)展程度也密切關(guān)系腦機接口產(chǎn)業(yè)發(fā)展。

納米材料

納米技術(shù)是21世紀(jì)戰(zhàn)略技術(shù)的制高點,當(dāng)材料三維空間的某一結(jié)構(gòu)單元處于納米尺寸,其特性將發(fā)生改變。這一類材料被叫做納米材料。由于它的尺寸已經(jīng)接近電子的相干長度,它的性質(zhì)因為強相干所帶來的自組織使得性質(zhì)發(fā)生很大變化。并且,其尺度已接近光的波長,加上其具有大表面的特殊效應(yīng),因此其所表現(xiàn)的特性,例如熔點、磁性、光學(xué)、導(dǎo)熱、導(dǎo)電特性等等,往往不同于該物質(zhì)在整體狀態(tài)時所表現(xiàn)的性質(zhì)。

納米材料與醫(yī)療的應(yīng)用被總結(jié)為米生物與醫(yī)學(xué)研究,這里面出了包含相關(guān)的材料特性和表征技術(shù),以及基于這些展開的對生命過程的檢測和調(diào)控研究,是納米科學(xué)領(lǐng)域的重要組成部分。具體而言,納米材料有醫(yī)學(xué)的應(yīng)用可以分為以下幾個方面。

■ 藥物遞送和納米藥物

其實早在20世紀(jì)60年代,人們發(fā)現(xiàn)有些納米材料作為載體,能輕松地跨越許多生物障礙。于是,納米材料就在藥物遞送方向得以應(yīng)用。1965年英國科學(xué)家Bangham發(fā)現(xiàn)脂質(zhì)體的時候,就開始涉及納米藥物載體。國內(nèi)藥劑學(xué)界也很早把納米給藥系統(tǒng)介紹到國內(nèi),并開始研究。

納米材料在藥物遞送方面的研究也有多個路徑,如通過脂質(zhì)體攜帶藥物、通過聚合物膠束,通過納米機器人或者自組織的藥物系統(tǒng)自組裝藥物。

納米藥物是用納米生物技術(shù)將藥物等生物活性分子與載體材料相復(fù)合,進而利用納米效應(yīng)改變所載活性成分藥代動力學(xué)、藥效及藥理學(xué)等方面的性質(zhì)而獲得顯著臨床優(yōu)勢的納米組裝體。所攜帶的成分可以是烷化劑、抗代謝類藥物等小分子化合物,也可以是多肽、蛋白質(zhì)、核酸藥物等大分子或造影劑。

最早,納米材料在藥物遞送過程中發(fā)揮的主要作用是運輸、緩釋等,如今則更專注在靶向性和大分子藥物的傳輸上。不過,在科研界已經(jīng)有發(fā)現(xiàn)既能夠載藥,又能夠治療的納米粒子,納米藥物的未來,很難以現(xiàn)在的眼光來定義。

■ 再生醫(yī)學(xué)

納米再生醫(yī)學(xué)是2018年公布的生物物理學(xué)名詞,指利用納米材料與技術(shù)模仿人體或動物組織或器官的微觀結(jié)構(gòu),研究其替換或誘導(dǎo)組織或器官的再生、重建或恢復(fù)其正常功能的學(xué)科。

再生醫(yī)學(xué)主要有細胞技術(shù)再生、材料再生,以及細胞和材料結(jié)合的再生研究。基于材料的再生研究是通過具備組織誘導(dǎo)特性的材料來實現(xiàn)的。通過將體外大量擴增得到的細胞種植在組織誘導(dǎo)材料的多孔支架上,將細胞在體外或體內(nèi)進行培養(yǎng)。隨后,生物基質(zhì)會在細胞生長完成后進行降解,最終重新得到活細胞、器官或者類器官。在材料相關(guān)的再生研究方向,納米材料具有絕對的領(lǐng)導(dǎo)地位。

■ 醫(yī)療器械

作為發(fā)展的基礎(chǔ),材料在醫(yī)療領(lǐng)域應(yīng)用非常廣泛,小到紗布、注射器,大到儀器設(shè)備,替換的人體組織和器官。材料在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用幾乎涉及到了方方面面。

在醫(yī)療器械領(lǐng)域,從工程化基礎(chǔ)到植入性材料,再到生物傳感器、探針,納米材料的身影隨處可見。如通過在納米粒子上連接抗體,對目標(biāo)分子進行定向診斷,如運用納米技術(shù)制備或構(gòu)建的含有納米顆粒的顯像載體,用于增強醫(yī)學(xué)成像反差等?;诩{米材料開發(fā)的分子診斷、生物成像技術(shù),以及熒光、生化檢測技術(shù)在疾病的早期診斷方面展現(xiàn)出前景。

納米材料生物醫(yī)藥、能源、化工催化等各個行業(yè)和領(lǐng)域均展現(xiàn)出卓越能力,也被全球多個國家和一眾科研機構(gòu)的重視。美國在2000年通過了《國家納米計劃》,將“納米科學(xué)、納米材料、材料與新的生產(chǎn)技術(shù)”作為優(yōu)先發(fā)展領(lǐng)域。

中國在“八五”期間也將“納米材料科技”列入了國家攀登項目,并在2001年發(fā)布了《國家納米科技發(fā)展綱要》;“十三五”期間還成立了國家納米科學(xué)中心、國家納米技術(shù)產(chǎn)業(yè)化基地、以及納米技術(shù)及應(yīng)用國家工程研究中心來推動基礎(chǔ)研究和應(yīng)用研究,以及產(chǎn)業(yè)化。

中科院體系和各個高校相關(guān)的納米科技研究平臺超過70個。無論是從戰(zhàn)略導(dǎo)向、產(chǎn)業(yè)需求和導(dǎo)向和研究熱度來看,納米材料都有可能是生物醫(yī)學(xué)材料領(lǐng)域最值得關(guān)注的領(lǐng)域,或許沒有之一。

分子遺傳學(xué)

測序技術(shù)的大規(guī)模應(yīng)用將現(xiàn)代醫(yī)學(xué)帶入了精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)時代?;蛘吒N切的說,是分子層面、遺傳學(xué)層面?;谶z傳學(xué)的驅(qū)動,現(xiàn)有的診療方案研發(fā)有了完全不同的思路,細胞治療、基因治療、免疫治療等過去看似遙不可及的治療方案走進現(xiàn)實。

分子遺傳學(xué)在近些年也被人熟知,或者說它已經(jīng)成為現(xiàn)實中的技術(shù),或許把它放在未來暢想中有些突兀。但之所以做這樣的決定,是因為現(xiàn)在所取代的成就還只是短短的一小段路程。如同人們對基因位點知之甚少,分子遺傳學(xué)的探索還有很長的路要走。當(dāng)然,這些探索更多可能是在單細胞層面、具體的基因位點表達層面等。

■ 表觀遺傳與基因組

DNA測序在過去十年中繼續(xù)占據(jù)主導(dǎo)地位,以指數(shù)增長的全基因組圖譜展示了所有層次(DNA、RNA和組蛋白)的調(diào)控。無論是轉(zhuǎn)錄組、組蛋白修飾、還是轉(zhuǎn)錄因子,科研界都做了大量研究,也積累了前所未有的數(shù)據(jù)。這些圖譜正在更好的向人們?nèi)腔蚺c表達的關(guān)系,對關(guān)的表觀遺傳學(xué)甲基化酶、閱讀蛋白、去甲基化酶等相關(guān)蛋白的作用和機理也有了更多的認知。大量的集成和多層表觀基因組分析提供了相當(dāng)全面的表觀基因組的圖譜景觀,包括它們在發(fā)育和疾病中的動態(tài)。但仍然有很多未解之謎。比如胞嘧啶甲基化的精確功能,比如脊椎動物和無脊椎動物的甲基化分別如何發(fā)生,比如發(fā)育中的敲除突變體胚胎為何死亡等等。

在大多數(shù)情況下表觀基因組的分析發(fā)展成為對許多表觀遺傳層面的極有價值、但仍處于描述性階段的理解。但還有許多問題,需要未來給出答案。

■ 基因、基因表達和疾病

Francis Collins曾言,除外傷以外,人類的各種疾病基本可以表達為遺傳因素(內(nèi)因)與環(huán)境因素(外因)共同作用的結(jié)果。無論是細胞治療還是免疫治療,藥物和治療方案研究的邏輯越發(fā)回歸到遺傳分子本身和基因、蛋白質(zhì)層面。現(xiàn)如今的諸多突破性治療方案也是從遺傳或者疾病發(fā)病機制層面出發(fā)。在遺傳和基因、蛋白質(zhì)表達檢測工具越發(fā)成熟的情況下,臨床診療方式有望被徹底改變。

然而如前文所說,從DNA到轉(zhuǎn)錄,到蛋白質(zhì),再到表型,人們?nèi)耘f知之甚少。因此,即便關(guān)于疾病與基因的研究由來已久,但這依舊會是未來的時代主題。

mRNA與生物醫(yī)藥

核酸藥物被譽為生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)但第三次革命,2017年前后,mRNA療法成為核酸藥物中明星。

mRNA即信使RNA,是由DNA的一條鏈作為模板轉(zhuǎn)錄而來的、攜帶遺傳信息能指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成的一類單鏈核糖核酸,在蛋白編碼過程中發(fā)揮著重要作用。簡單來說,mRNA由DNA轉(zhuǎn)錄得到,直接指導(dǎo)蛋白質(zhì)翻譯,是行使生命活動的直接指令單元,而蛋白質(zhì)是行使生命活動功能的主要單元。因此,基于蛋白翻譯的中心法則,mRNA相關(guān)的藥物、疫苗、生物療法在近些年成為熱點。

■ 蛋白替換療法

而伴隨著mRNA的修飾、遞送等技術(shù)的發(fā)展,基于mRNA的蛋白質(zhì)替代治療應(yīng)運而生。

蛋白質(zhì)替代治療即引入治療性抗體和功能蛋白,通過注射mRNA轉(zhuǎn)染至體細胞后翻譯出蛋白質(zhì),以替換異常蛋白質(zhì)或作為缺乏蛋白質(zhì)的補充,目前已在遺傳性代謝疾病、實體瘤、心血管疾病等領(lǐng)域得到初步應(yīng)用。相較于其他應(yīng)用,mRNA蛋白替代療法研發(fā)還尚在早期探索中,但根據(jù)現(xiàn)有臨床結(jié)果顯示其應(yīng)用潛力巨大,已初步驗證了其安全性以及療效。

■ 腫瘤免疫

人工合成的mRNA能夠為任何蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)片段或肽的合成提供模板,在藥物研究中有著諸多應(yīng)用,腫瘤免疫也是其中之一。

我們可以將mRNA癌癥疫苗視為一段人工合成mRNA。在注射mRNA癌癥疫苗后,mRNA編碼的蛋白質(zhì)由核糖體合成,然后翻譯后修飾以產(chǎn)生正確折疊的功能蛋白質(zhì),并呈現(xiàn)給免疫系統(tǒng)。該過程類似于RNA病毒感染和連續(xù)誘導(dǎo)保護性免疫反應(yīng)的自然過程。理論上mRNA癌癥疫苗可以編碼任何蛋白質(zhì),也可以通過編碼出特定蛋白影響腫瘤免疫微環(huán)境,克服腫瘤免疫耐受。這已成為mRNA腫瘤疫苗研究的一個重要方向。如BioNTech就將新一代CAR-T療法與mRNA疫苗聯(lián)合,用于實體瘤治療研究。

■ 疫苗

如上文所講,人工合成mRNA可以編碼任意蛋白,可以產(chǎn)生靶標(biāo)蛋白或免疫原,激活體內(nèi)免疫反應(yīng),以對抗各種病原體。并且,這一類疫苗在安全性、生產(chǎn)成本上也具備優(yōu)勢。mRNA疫苗利用的是病毒的基因序列而不是病毒本身,不帶有病毒成分,沒有感染風(fēng)險;生產(chǎn)上,mRNA不需要佐計,易于批量生產(chǎn)、成本低。

全球領(lǐng)域有無數(shù)家mRNA疫苗公司,其中最受矚目當(dāng)屬BioNTech、Moderna、CureVac。這些公司當(dāng)產(chǎn)品管線大多圍繞腫瘤展開。不過,相比傳統(tǒng)疫苗8-14年的研發(fā)周期,mRNA疫苗的研發(fā)周期明顯更短,或許除了腫瘤以外,mRNA疫苗在更多疾病和傳染病預(yù)防等場景還有更多可能。

實驗室智慧化

智慧化建設(shè)在傳統(tǒng)工業(yè)領(lǐng)域已經(jīng)有較為成熟的運用,例如食品、汽車生產(chǎn)等領(lǐng)域通過全自動流水線建設(shè),部分替代,甚至某些領(lǐng)域?qū)崿F(xiàn)全面代替人工。近年來,醫(yī)療和科研領(lǐng)域的實驗室也意識到了智慧化建設(shè)的作用,例如通過自動化設(shè)備或流水線建設(shè)替代重復(fù)性高的機械性人工操作、通過信息化建設(shè)將實驗室信息數(shù)據(jù)化從而避免人工記錄錯誤、通過數(shù)字化建設(shè)幫助實驗更高效運營等。在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域包括臨床檢驗檢測、藥物研發(fā)、生物實驗等多類型實驗室也開始嘗試通過自動化、信息化及數(shù)字化的建設(shè)讓實驗室從多維度“智慧”起來,這類實驗室,我們稱之為智慧醫(yī)學(xué)實驗室。

■ 藥物研發(fā)

藥物的構(gòu)效關(guān)系是指藥物的化學(xué)活性與藥效的關(guān)系。傳統(tǒng)的構(gòu)效關(guān)系研究以定性研究為主,現(xiàn)實對物質(zhì)結(jié)構(gòu)與活性的關(guān)系進行推測,再確定靶酶活性位點的結(jié)構(gòu)并設(shè)計。在自動化場景中,計算機為輔助工具的定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR)方法成為合理藥物設(shè)計的重要方法之一。

在藥物設(shè)計環(huán)節(jié),靶蛋白 3D 結(jié)構(gòu)對于基于結(jié)構(gòu)的藥物發(fā)現(xiàn)至關(guān)重要,人工智能與自動化工具已經(jīng)初見成效,如 AlphaFold 在對目標(biāo)蛋白質(zhì) 3D 結(jié)構(gòu)的預(yù)測已經(jīng)相當(dāng)精準(zhǔn)。而人工智能與冷凍電鏡這種組合,也讓藥物研發(fā)的效率和精度實現(xiàn)某種程度上的雙向提升。

■ 樣本管理

智慧化的樣本培養(yǎng)和存儲,以及樣本管理能夠讓實驗室的樣本管理更有效、有序和安全。比如,通過精準(zhǔn)控制樣本的溫度、適度,對樣本進行妥善保存,避免因認為因素造成的樣本損失。比如基于機器人、AI 和自動化等技術(shù)的全流程樣本植被,能夠在節(jié)省人力的同時使得同一制備條件的樣本真正保持同一標(biāo)準(zhǔn)和質(zhì)量,在多類實驗并行制樣以及同一樣本并行實施多類實驗前處理,保證了樣本的一致性從而讓產(chǎn)出的數(shù)據(jù)真實、可靠等。

■ 數(shù)據(jù)分析和管理

實驗環(huán)節(jié)中,數(shù)據(jù)下機只是第一步,通常需要經(jīng)過漫長而精細的數(shù)據(jù)分析處理才能反映出某一階段的結(jié)果。當(dāng)然,這里的“數(shù)據(jù)”可能是真正的數(shù)據(jù),也可能是圖片和實驗人員記錄下來的文字。尤其是研究型實驗室,數(shù)據(jù)的維度和處理需求越是復(fù)雜,除了數(shù)據(jù)的模塊化以外,還涉及大量的計算。不僅如此,數(shù)據(jù)的存儲、調(diào)用和查詢通常也是復(fù)雜的工作?;谥腔刍膶嶒灁?shù)據(jù)管理,能夠?qū)崿F(xiàn)安全、有效、有序的存儲,對實驗效率提升作用明顯。

智慧化實驗室的應(yīng)用還有很多,或者說這其實是一個開放性的“選題”,其應(yīng)用場景取決于實驗室降本增效的需求。相比本文中的其他技術(shù),自動化實驗室其實是一個基于多種技術(shù)形成的產(chǎn)品,或許其底層技術(shù)來自科研端,但其應(yīng)用和產(chǎn)品化更多時候可能是商業(yè)化公司推動。

AI與空間組學(xué)

空間組學(xué)(Spatial omics)作為《Nature》2022值得年度關(guān)注的七大榜單技術(shù),被譽為“生命科學(xué)”的下一個風(fēng)口。

蛋白質(zhì)是所有細胞的功能性分子,并且是所有生物過程的效應(yīng)產(chǎn)物。蛋白質(zhì)的空間表達對于確定蛋白質(zhì)在組織中的準(zhǔn)確定位和功能至關(guān)重要,其可隨著細胞類型、細胞周期進展、疾病狀態(tài)和診療方法的變化而改變。因此,空間蛋白質(zhì)組學(xué)可以用來研究疾病相關(guān)的蛋白質(zhì)空間表達譜變化,為尋找生物標(biāo)志物和開發(fā)新的診療方法提供全新的視角。近年來,空間蛋白質(zhì)組學(xué)研究在微環(huán)境與疾病發(fā)展、機制與藥物靶點、器官結(jié)構(gòu)異質(zhì)性和組織器官空間圖譜等方面取得了突出的進展。

■ 腫瘤微環(huán)境研究

空間蛋白質(zhì)組學(xué)開辟了解析組織微環(huán)境、組織生物標(biāo)記物開發(fā)、疾病診斷與預(yù)后、以及精準(zhǔn)醫(yī)療等領(lǐng)域全新的研究視角,也有望將臨床診斷往疾病本質(zhì)更進一步。

空間蛋白組學(xué)在臨床診斷的突破性之一在與對細胞微環(huán)境的檢測。在臨床研究中,目前空間蛋白組學(xué)更多的方向是對腫瘤微環(huán)境的應(yīng)用研究。

癌癥微環(huán)境類似于一個生態(tài)系統(tǒng),是一個具有不同細胞群體和物種的混合物。例如,物種豐富度(也可以指腫瘤內(nèi)的異質(zhì)性)可能與免疫治療的穩(wěn)定性和患者的長期預(yù)后有關(guān)。免疫細胞和癌細胞之間的代謝競爭,可以稱為種間競爭,也是癌癥進展的關(guān)鍵決定因素。

通過提供系統(tǒng)層面的細胞和分子圖譜的精確空間坐標(biāo),空間組學(xué)正在改變我們對癌癥環(huán)境的理解。比如《Nature Biotechnology》上一篇名為“Deep Visual Proteomics defines single-cell identity and heterogeneity”的文章,研究人員就通過獲取空間多組學(xué)圖譜可以以整體方式重建腫瘤發(fā)生的關(guān)鍵過程。

空間蛋白組技術(shù)能區(qū)別具有特異性表型的細胞,并借助蛋白組學(xué)分析該細胞的潛在功能。在黑色素瘤組織中精確分析出僅在腫瘤區(qū)域中出現(xiàn)的與免疫調(diào)控和DNA復(fù)制相關(guān)的特征性蛋白。這使得跨二維組織切片的癌癥進展的失調(diào)關(guān)鍵途徑的可視化成為可能。

■ 疾病機制與藥物發(fā)現(xiàn)

空間蛋白質(zhì)組學(xué)直接從其天然組織環(huán)境中比較和對比單一的細胞類型和狀態(tài),可獲取到蛋白組對應(yīng)的細胞類型與空間信息,能夠找到更精準(zhǔn)的疾病關(guān)鍵靶標(biāo)蛋白及診治生物標(biāo)志物。如Nature正刊發(fā)表的題為“Proteomics reveals NNMT as a master metabolic regulator of cancer-associated fibroblasts”的文章,針對卵巢癌以及卵巢癌附近基質(zhì)開展空間蛋白質(zhì)組學(xué)分析,成功揭示了NNMT作為基質(zhì)細胞對腫瘤轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵調(diào)控靶點,也為未來有針對的卵巢癌轉(zhuǎn)移靶向治療提供了新的思路。

一些研究者也已成功運用空間蛋白質(zhì)組學(xué)來研究疾病,包括急性病毒感染和肝病,或闡明單基因疾病背后的細胞缺陷。目前已經(jīng)達到了空間蛋白質(zhì)組學(xué)最終與其他“組學(xué)”技術(shù)、細胞生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究相結(jié)合的地步,從而為生物過程提供無偏見的系統(tǒng)層面的見解。目前可用的空間蛋白質(zhì)組學(xué)方法是高度互補的,它們各自的發(fā)展優(yōu)勢和局限性使它們適合于不同類型的應(yīng)用。

超分辨率顯微成像

自列文虎克發(fā)明第一臺顯微鏡以來,人們變開始了對微觀世界的探索和觀察。在微觀世界的研究歷史中,光學(xué)顯微鏡功不可沒。基于光學(xué)顯微鏡,人們第一次看到了細胞、發(fā)現(xiàn)了微生物。

然而,隨著微觀的研究從微觀世界深入到微觀結(jié)構(gòu),光學(xué)顯微鏡的局限也因此出現(xiàn)。光學(xué)顯微鏡受制于光學(xué)衍射極限,無法對極限值以外的分子和結(jié)構(gòu)進行觀察。盡管隨后也誕生了掃描電鏡等納米級別分辨率的顯微鏡,但在實際應(yīng)用中或多或少都存在一些缺陷。

2006年是超分辨率纖維成效技術(shù)的問世之年。美國科學(xué)家Eric Betzig等首次在期刊Science上提出了光激活定位顯微技術(shù)(PALM)的概念,讓人類能以精確視角窺探到小于衍射極限的納米級微觀世界光學(xué)圖像。他也因此獲得2014年諾貝爾化學(xué)獎。

同樣是2006年,哈佛大學(xué)莊小威團隊成功開發(fā)隨機光學(xué)重建顯微技術(shù)(STORM)。由于省去了光漂白步驟,相較于PALM,STORM在快速數(shù)據(jù)采集上更有優(yōu)勢。

不同與其他超分辨觀測,可進行活細胞觀測。因此,超分辨率成像技術(shù)的應(yīng)用主要幾種在生物學(xué)、農(nóng)學(xué)、畜牧、獸醫(yī)科學(xué)領(lǐng)域。

■ 活細胞相關(guān)的研究

當(dāng)觀測的分辨率能夠微觀到亞細胞結(jié)構(gòu),生物學(xué)研究或許將被重新定義。

在比如骨細胞研究。骨折修復(fù)與成骨細胞和破骨細胞有關(guān)。骨骼中發(fā)現(xiàn)的成骨細胞和破骨細胞都與骨折的修復(fù)有關(guān),成骨細胞和破骨細胞之間的主要區(qū)別在于,成骨細胞與骨骼的形成和礦化有關(guān),而破骨細胞與骨骼的分解和吸收有關(guān)。通過結(jié)合基因編輯和超分辨率成像技術(shù),可以觀察和研究敲除不同基因位點對蛋白表達和細胞表達之間的關(guān)系,從而有望尋找到利于骨骼修復(fù)的表達機制和治療方案。

不僅如此,亞細胞結(jié)構(gòu)細節(jié)的可視化,同樣意味著蛋白質(zhì)定位和功能研究的工具取得突破,能夠在單分子水平上直接觀察到這些目標(biāo)分子的動態(tài)特征。以神經(jīng)科學(xué)為例。大腦是復(fù)雜的神經(jīng)元網(wǎng)絡(luò),人類大腦包含超過800億個神經(jīng)元,每個神經(jīng)元由數(shù)千個突觸連接。由于衍射極限的尺寸限制,熒光顯微成像技術(shù)無法觀測到神經(jīng)突觸信號傳遞等現(xiàn)象。而超分辨率成像技術(shù)則使得這一切成為可能。如果通過成像技術(shù)觀測神經(jīng)突觸之間的遞質(zhì)運輸、釋放,蛋白質(zhì)的折疊,或許人們對神經(jīng)系統(tǒng)以及神經(jīng)系統(tǒng)疾病的理解將出現(xiàn)質(zhì)的飛躍。

■ 細胞器功能及活動研究

盡管光學(xué)顯微鏡和電子顯微鏡已經(jīng)能看到包括線粒體、葉綠體在內(nèi)的多個細胞器,但這些細胞器是如何活動和發(fā)揮功能的,前兩類顯微鏡就顯得無能為力。超分辨率成像技術(shù)的突破,也使得對于細胞器功能和活動的研究取得了多項新的突破。比如細胞內(nèi)脂肪的存儲和代謝、線粒體與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的互作如何影響線粒體的分裂與融合。這些在“細胞工場”內(nèi)進行的活動可能與骨骼肌、心臟等器官和組織的代謝有關(guān),異常的代謝可能導(dǎo)致某些疾病。對細胞器功能和活動研究的深入,也許會帶來對某些代謝性疾病研究的新思路。

■ 核酸成像

DNA、RNA是多種基本生物學(xué)過程的關(guān)鍵,其能傳遞遺傳信息,將其轉(zhuǎn)化為蛋白質(zhì)或支持基因調(diào)控。為了“看見”遺傳分子,人們做出了許多努力,目前最成功的的要數(shù)測序技術(shù)。但測序技術(shù)的本質(zhì)其實是檢測、計算與統(tǒng)計,即便準(zhǔn)確性已經(jīng)非常高,但我們依然不能認為其結(jié)果是絕對的。另一方面,測序技術(shù)需要經(jīng)歷核酸分子的打碎和重新組裝,無法對活細胞的遺傳物質(zhì)進行解析。

超分辨率成像技術(shù)的出現(xiàn),使得活細胞的核酸成像達到了前所未有的分辨率。如哈佛大學(xué)莊小威教授的研究,她與團隊圍繞顯微技術(shù)攻關(guān)開發(fā)了多項技術(shù),包括但不限于單分子動力學(xué)、核酸與蛋白的相互作用、基因表達機制、細胞核病毒的相互作用等。其中在核酸成像,其團隊首次揭示了人類染色體的三位結(jié)構(gòu),開拓了檢測DNA與蛋白質(zhì)相互作用的新技術(shù),構(gòu)建了下丘腦視前區(qū)的細胞空間圖譜.......她和團隊在單分子動力學(xué)、核酸與蛋白的相互作用、基因表達機制、細胞核病毒的相互作用等領(lǐng)域做出了杰出的貢獻。

此外,莊小威教授還和David R.Walt教授等人成立了開發(fā)下一代空間解析單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)的生物醫(yī)藥公司Vizgen,將利用超分辨率成像技術(shù)突破空間分辨單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)的界限,對健康和病理組織的分子和細胞組織做進一步的研究。

總的來說,超分辨率成像技術(shù)是活細胞層面的研究利器,基于這一技術(shù),人們有望一窺生物學(xué)的更多秘密。

結(jié)語

以上是橙果局基于產(chǎn)業(yè)觀察、訪談,以及前沿科研動態(tài)總結(jié)的2023年“十大前沿創(chuàng)新”?;蛟S由于我們淺薄的認知和粗淺知識,“猜想”名單中不免會有信息不正確、疏漏,或者描述不當(dāng)?shù)牡胤剑覀兤诖⒏兄x您的指正。同樣重要的是,科技創(chuàng)新是星辰大海,我們目之所及,恐怕連冰山一角都不到。如果關(guān)于未來科技,如果您有不同都看法和猜想,歡迎留言分享。

本文為轉(zhuǎn)載內(nèi)容,授權(quán)事宜請聯(lián)系原著作權(quán)人。

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2023年生物科技最值得關(guān)注的“十大前沿創(chuàng)新”

2023年最值得關(guān)注的“十大前沿創(chuàng)新”

文|動脈網(wǎng)

在過去一年中,橙果局訪問了近百位科學(xué)家,數(shù)十位創(chuàng)業(yè)者和投資人。在與他們的交流中,我們反復(fù)的去討論同一個話題,未來的創(chuàng)新在哪里?通過與這些人的交流,以及對產(chǎn)業(yè)的觀察,我們堅信未來的創(chuàng)新將有技術(shù)引領(lǐng)。

未來屬于哪些技術(shù)呢?是頗具科幻概念的量子計算,還是各國戰(zhàn)略布局的重點的腦科學(xué),又或者是被《Nature》譽為“生命科學(xué)”的下一個風(fēng)口的空間組學(xué)?

辭舊迎新,正是各類榜單集中發(fā)布的時候。作為關(guān)注前沿創(chuàng)新與成果轉(zhuǎn)化的垂直媒體,在大量訪談、調(diào)研和資料收集后,關(guān)于未來創(chuàng)新的技術(shù)猜想,橙果局也有一份清單要與你分享。Shall we?

量子計算

2022年諾貝爾物理學(xué)獎授予奠定量子計算基礎(chǔ)的科學(xué)家Alain Aspect、John Clauser和Anton Zeilinger,他們因詳細描述了量子糾纏而獲得物理學(xué)最高榮譽。三位科學(xué)家彌合了理論與實際應(yīng)用之間的鴻溝,也為當(dāng)今的量子計算行業(yè)鋪平了道路。

本質(zhì)上,量子計算是一種新型計算模式,遵循量子力學(xué)規(guī)律。對照于傳統(tǒng)的通用計算機,其理論模型是用量子力學(xué)規(guī)律重新詮釋的通用圖靈機。從可計算的問題來看,量子計算機只能解決傳統(tǒng)計算機所能解決的問題,但是從計算的效率上,由于量子力學(xué)疊加性的存在,某些已知的量子算法在處理問題時速度要快于傳統(tǒng)的通用計算機。

潘建偉院士曾指出,量子計算是基于量子力學(xué)的全新計算模式,具有原理上遠超經(jīng)典計算的強大并行計算能力,為人工智能、密碼分析、氣象預(yù)報、資源勘探、藥物設(shè)計等所需的大規(guī)模計算難題提供了解決方案,并可揭示量子相變、高溫超導(dǎo)、量子霍爾效應(yīng)等復(fù)雜物理機制。

2019年,谷歌宣稱實現(xiàn)了“量子霸權(quán)”,并登上了《Nature》雜志封面。這項技術(shù)將如何對醫(yī)療保健部門產(chǎn)生重大影響,將醫(yī)療決策推向了全新的水平。

量子計算在醫(yī)療保健中的應(yīng)用非常多,覆蓋藥物設(shè)計、臨床診斷、生物信息、醫(yī)療大數(shù)據(jù)等方面,量子計算正以更快的決策、更安全的數(shù)據(jù)保護、更便宜高校的數(shù)據(jù)分析影響著醫(yī)療與創(chuàng)新。

■ 靶點的識別和分析

結(jié)合現(xiàn)在藥物研發(fā)的流程,量子計算在藥物發(fā)現(xiàn)的降本增效上展現(xiàn)出潛力和價值。靶點是指藥物進入人體后同生物大分子結(jié)合的部位,靶點類型包括受體、酶、離子通道等生物大分子,是藥物研發(fā)的起點。

靶點的識別主要有兩種思路:一是對有豐富實驗數(shù)據(jù)的大分子進行晶體結(jié)構(gòu)分析;二是先進行分子結(jié)構(gòu)的預(yù)測再進行實驗分析。無論哪種方式,都繞不開分子結(jié)構(gòu)的預(yù)測。無論是CADD還是AIDD,如果沒有算力和數(shù)據(jù)的支撐都很難實現(xiàn)動態(tài)和精準(zhǔn)的結(jié)構(gòu)預(yù)測。

而量子計算的出現(xiàn)則有望實現(xiàn)靶點識別的加速。如蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)預(yù)測,量子計算可以通過模擬氨基酸、分子間的相互作用從而得到精準(zhǔn)靶點對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測。D-Wave、ProteinQure等很多家初創(chuàng)公司在探索。

■ 候選化合物篩選

藥物篩選是發(fā)現(xiàn)先到化合物的必須路徑,通過對化合物的生物活性、藥理、毒理的評估,預(yù)測化合物成效的可能性和價值。目前藥物篩選的方式有兩種,一是基于高通量的試驗篩選,二是基于計算機模型的虛擬篩選。

虛擬篩選是藥物篩選的發(fā)展趨勢,但對于缺乏實驗數(shù)據(jù)的化合物和高精度算法,目前能夠發(fā)揮的價值有限。而量子計算在精準(zhǔn)性和速度上都更有優(yōu)勢,在藥物篩選上也具備發(fā)展前景。目前已經(jīng)有多家藥企開始了探索,如羅氏與劍橋量子計算在2021年的合作,目的就是探索量子計算在化合物篩選上的潛力,并希望以此再度挑戰(zhàn)阿爾茲海默癥。

■ 化合物優(yōu)化

候選化合物并不意味著它就具備了成效能力,或多或少,這些化合物都存在缺陷,如毒副作用大、活性不高等問題。因此,真毒篩選出的候選化合物,還需要對化合物進行優(yōu)化,以獲得有可能成藥的化合物分子。

化合物結(jié)構(gòu)的優(yōu)化首先要了解化合物的結(jié)構(gòu),其次還需要對調(diào)整后的化合物特性做出預(yù)判。無疑,這也可能是量子計算的主場——化合物結(jié)構(gòu)調(diào)整遵循量子力學(xué)。這一方面,谷歌的量子計算團隊已經(jīng)進行了探索,谷歌的量子計算機在2020年登上《Science》封面,主要成果就是用12個量子比特模擬了二氮烯的異構(gòu)化反應(yīng)。

■ 臨床診斷

在臨床診斷中,量子計算也具有非常大的應(yīng)用潛力。

一方面是量子計算與成像技術(shù)的結(jié)合。磁共振指紋(MRF)是一種基于量子計算的新技術(shù),可以在較短的掃描時間內(nèi)同時量化多種組織特性。2018NIAN ,微軟與Case Western Reserve大學(xué)的研究人員合作開發(fā)了一種磁共振指紋(MRF)技術(shù),研究人員將先進的量子計算計算用于創(chuàng)造更高質(zhì)量的成像技術(shù),并利用HoloLens增強現(xiàn)實平臺將3D影像展示給醫(yī)生?;谠撈脚_,醫(yī)生能夠能夠?qū)崿F(xiàn)癌癥患者單次化療之后的療效。

量子計算機與機器學(xué)習(xí)相結(jié)合,將用于醫(yī)學(xué)診斷和概率推理也是一個方向。劍橋量子計算(CQC)的科學(xué)家開發(fā)出一種方法,證明了量子機器可以從非常普遍的概率推理模型中推斷出隱藏信息。這些方法可以改善很多應(yīng)用,包括復(fù)雜系統(tǒng)中的推理和量化不確定性。例如在醫(yī)療診斷,關(guān)鍵任務(wù)機器中的故障檢測或投資管理的財務(wù)預(yù)測。

此外,量子計算還可以較容易的對復(fù)雜高緯度的數(shù)據(jù)進行整理,適用于核磁共振、血管造影的診斷技術(shù)的智能化。

■ 大數(shù)據(jù)與生物信息

既然是計算,那么量子計算技術(shù)與生物信息勢必會有好故事可以說。

量子計算可以高效地產(chǎn)生復(fù)雜的數(shù)據(jù)分布,在基因序列的排列、對比和組裝等過程中都能夠發(fā)揮作用,通過近似優(yōu)化算法減少計算量,縮短計算時間。而對于多組學(xué)數(shù)據(jù)的整合,量子計算也可以比經(jīng)典計算方法更快、更精準(zhǔn)的從復(fù)雜數(shù)據(jù)分布中尋找到模型和規(guī)律。這也為醫(yī)療大數(shù)據(jù)的應(yīng)用提供了契機。

除了數(shù)據(jù)存儲、結(jié)構(gòu)化以外,大數(shù)據(jù)的應(yīng)用還有運算。而隨著多組學(xué)的發(fā)展,醫(yī)療大數(shù)據(jù)已經(jīng)遠不能用海量來形容,數(shù)據(jù)和臨床表型的聯(lián)系也復(fù)雜而多樣。這是現(xiàn)有的計算能力無法勝任的,需要有更強算力、更快計算速度、更深層次數(shù)據(jù)處理能力的計算方法支持。量子計算或許就是幫助人們從大量非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)中尋找答案的利器。

■ 醫(yī)療保健

承接上文,量子計算能夠從海量數(shù)據(jù)中尋找規(guī)律,或使數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)化。那么這些數(shù)據(jù)可以干什么?或許有一個答案呼之欲出——個性化的醫(yī)療或者健康管理。

筆者想到了一家美國的醫(yī)療保健公司Human Longevity,這家公司最早由Craig Venter創(chuàng)立。我們先不談公司和Craig Venter之間的愛恨糾葛,來看看他的商業(yè)邏輯:

最早Human Longevity希望利用基因組學(xué)、干細胞技術(shù)、大數(shù)據(jù)、人工智能等新技術(shù),找到人類衰老的根源,以及隨之而來的疾病的內(nèi)在原因,并發(fā)現(xiàn)相應(yīng)的藥物或療法,以撥慢老去的時鐘。但經(jīng)過多難的發(fā)展,這樣理想始終難以實現(xiàn),而讓Human Longevity真正實現(xiàn)引領(lǐng)的,其實是基于基因測序等臨床診斷技術(shù)的高端體檢和健康管理業(yè)務(wù)。

基于Human Longevity有兩點值得想象,其一是基于多組學(xué)的健康管理是一個可以成立的商業(yè)邏輯;其二則是基于多組學(xué)技術(shù)進行藥物或者療法研發(fā)的商業(yè)邏輯是否能夠通過量子計算補齊?

換而言之,量子計算的除了能力為醫(yī)療保健和藥物研發(fā)都提供了新的路徑。如果基于量子計算,海量的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)能夠得以應(yīng)用,或許能夠為臨床診療、健康管理和藥物研發(fā)都帶來新的體驗。也正式如此,盡管某些應(yīng)用還處于暢想階段,仍有無數(shù)的研究人員、科技巨頭和初創(chuàng)公司為之奔赴。

中國成了目前世界上唯一在兩種物理體系達到“量子計算優(yōu)越性”里程碑的國家。基礎(chǔ)研究上,中國量子物理研究水平居世界前列,兩項項成果入選國際物理學(xué)領(lǐng)域“十強”。產(chǎn)業(yè)端,無論是量子計算還是產(chǎn)業(yè)應(yīng)用,國內(nèi)都已經(jīng)開始,并已獲得資本與產(chǎn)業(yè)共同關(guān)注。盡管在具體應(yīng)用比美國稍微滯后,但基礎(chǔ)研究的底蘊和市場需求下,中國的量子計算或許有無限可能。

再生醫(yī)學(xué)研究

器官能夠再生、人體能夠長生不老……再生醫(yī)學(xué)讓以往出現(xiàn)在科幻片中的情節(jié)有機會成為現(xiàn)實。再生醫(yī)學(xué)是指利用生物學(xué)及工程學(xué)的理論方法創(chuàng)造丟失或功能損害的組織和器官,促進機體自我修復(fù)和再生,使其具備正常組織和器官的結(jié)構(gòu)和功能。除了目前已經(jīng)逐步實現(xiàn)的皮膚、組織再生,新材料、新技術(shù)的涌現(xiàn)讓更宏偉的“再生”成為可能。

■ 器官“再生”

生物再生材料具有優(yōu)異的組織誘導(dǎo)性,將生物再生材料植入人體,可誘導(dǎo)缺損組織和器官進行再生修復(fù),應(yīng)用于骨科、神經(jīng)外科、心血管、眼科、口腔、醫(yī)美等領(lǐng)域。在再生研究中,材料發(fā)揮的作用主要有兩個方面,其一是促進再生,其二則是為細胞的生長提供支撐。

目前已經(jīng)成功走向市場的生物再生材料/產(chǎn)品主要是針對成分和結(jié)構(gòu)相對簡單的皮膚、骨組織再生。一些新的跨界融合或許能夠?qū)崿F(xiàn)更為復(fù)雜組織的“再生“。比如一些自身無法再生的組織,如器官、已經(jīng)缺失的組織等,通過再生材料和干細胞進行結(jié)合,可在體外進行培養(yǎng)從而實現(xiàn)這些組織的再生。

帝國理工學(xué)院生物材料科學(xué)教授Molly Stevens曾在一次訪談中提到,她現(xiàn)在在全世界范圍內(nèi)有很多這樣的干細胞實驗,使用過很多不同種類的細胞,但似乎得到的都是同一個結(jié)果——這些細胞一旦移植通常都會死掉。但如果能和材料結(jié)合,形成一個體內(nèi)生物反應(yīng)器,其生存率必然大大提高。四川大學(xué)解慧琪教授課題組研究了來自不同來源間充質(zhì)干細胞?;谀蛟葱愿杉毎?,研究團隊繼續(xù)針對腎臟、尿道、膀胱修復(fù)、心肌修復(fù)、食管修復(fù)和干細胞、軟骨關(guān)鍵修復(fù)等做了大量研究。

基于材料疊加干細胞的再生醫(yī)學(xué)研究,正在成為再生醫(yī)學(xué)研究的未來趨勢?;谶@樣的思路,或許器官再生的未來不遠。

■ 衰老相關(guān)疾病治療

除了創(chuàng)傷,衰老也會給細胞和器官、組織帶來損傷。這個過程是長期進行且不可逆的。細胞進入衰老階段后回表現(xiàn)出不可逆的、抗凋亡的有絲分裂停滯狀態(tài),導(dǎo)致它們在基因表達、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和細胞行為上發(fā)生功能改變。而在人的層面,則表現(xiàn)為器官功能下降,以及某些疾病的發(fā)生。

人們曾癡迷尋找長生的答案,卻發(fā)現(xiàn)隨著壽命的延長,衰老本身就成為了生命健康的風(fēng)險?,F(xiàn)如今,人口老齡化將成為世界的經(jīng)濟增長和可持續(xù)性發(fā)展的重大威脅。距離人們首次證明了衰老過程是可塑的已經(jīng)近百年,限制熱量、清除衰老細胞、干細胞療法、微生物治療.......各類研究百花齊放。盡管人口老齡化問題仍在加劇,但隨著對衰老的深入了解,延緩衰老將漸行漸近。

不可回避的是,中國再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的發(fā)展仍舊處于極早期。骨修復(fù)、再生醫(yī)美、口腔修復(fù)等產(chǎn)品已經(jīng)實現(xiàn)商業(yè)化,再生器官等高技術(shù)壁壘的產(chǎn)品還停留在科研層面,據(jù)悉,再生腎臟、再生心臟在全球范圍內(nèi)都沒有產(chǎn)品進入臨床。發(fā)展,除了基礎(chǔ)研究和應(yīng)用研究的突破以外,產(chǎn)業(yè)化還需要監(jiān)管、資本和上下游的協(xié)同發(fā)力。

數(shù)字技術(shù)

數(shù)字技術(shù)是與電子計算機相伴相生的科學(xué)技術(shù),它是指借助一定的設(shè)備將各種信息,包括:圖、文、聲、像等,轉(zhuǎn)化為電子計算機能識別的二進制數(shù)字“0”和“1”后進行運算、加工、存儲、傳送、傳播、還原的技術(shù)。

將數(shù)字技術(shù)與醫(yī)療過程結(jié)合誕生了數(shù)字醫(yī)療,數(shù)字醫(yī)療設(shè)備、數(shù)字療法的出現(xiàn),極大地豐富了臨床的診療。通過醫(yī)療信息化產(chǎn)生的數(shù)據(jù)積累,互聯(lián)網(wǎng)醫(yī)療的交互形式,以及AI、3D打印等新型技術(shù)的發(fā)展,數(shù)字醫(yī)療正在孕育一個新的業(yè)務(wù)形態(tài)。

■ 數(shù)字醫(yī)療設(shè)備

醫(yī)療的數(shù)字化,首先是診療設(shè)備的數(shù)字化,這是數(shù)字化醫(yī)療的基礎(chǔ)。所謂數(shù)字化的醫(yī)療設(shè)備,指的是以計算機技術(shù)為基礎(chǔ),信號采集和功率輸入盡量靠近前端,控制、數(shù)據(jù)采集、處理、存儲與傳輸、執(zhí)行等過程信息均實現(xiàn)數(shù)字化。另外,數(shù)字化的醫(yī)療設(shè)備具有更為清晰的圖像和更為精確地量化衡量方式,為醫(yī)生進行更為精確的診斷提供物質(zhì)和技術(shù)保障。在計算機軟件下工作的醫(yī)療設(shè)備,已逐漸取代常規(guī)設(shè)備成為臨床設(shè)備的主流。

數(shù)字醫(yī)療設(shè)備的出現(xiàn),大大豐富了醫(yī)學(xué)信息的內(nèi)涵和容量。如心電(ECG)和腦電(EEG)等電生理信息的可視化,CT、MRI等影像的三維、四維可視化,數(shù)字技術(shù)與醫(yī)療的結(jié)合正在為臨床科室?guī)砣碌捏w驗。

可視化是數(shù)字醫(yī)療設(shè)備的主要方向,因此,數(shù)字化成像設(shè)備是數(shù)字醫(yī)療設(shè)備的重要部分。大多數(shù)此類設(shè)備可以直接從數(shù)字接口采集圖像。目前這些設(shè)備的接口也正在區(qū)域標(biāo)準(zhǔn)化,無論是實際圖像還是模擬圖像,接口都已經(jīng)有相應(yīng)的規(guī)定和標(biāo)準(zhǔn)。

此外,通過多學(xué)科先進技術(shù)的融合,數(shù)字醫(yī)療設(shè)備往往能夠呈現(xiàn)深層、高清的圖像,是的病癥、病灶和病理的確認時間提前、結(jié)果更清晰和精準(zhǔn),也極大的提高了臨床診療的效率和質(zhì)量。

當(dāng)然,除了可視化以外,網(wǎng)絡(luò)化、智能化趨勢也清晰可見。

■ 醫(yī)院管理

長期以來,醫(yī)院一直在尋找安全、高效而便捷的管理方案。數(shù)據(jù)管理一直是醫(yī)院管理的難題,數(shù)據(jù)質(zhì)量需要保持準(zhǔn)確性、一致性和及時性,底層數(shù)據(jù)的采集與互聯(lián)需要及時、準(zhǔn)確而高校,數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)化需要深度智能化......這些都有望通過數(shù)字化的醫(yī)院管理創(chuàng)新實現(xiàn)。

管理者可以通過網(wǎng)絡(luò)隨時了解醫(yī)院的運營情況及各部門的工作情況,使醫(yī)院始終處于最佳運行狀態(tài)。而且,醫(yī)院可以隨時為病人提供各種所需的診療信息。同時,基于對底層數(shù)據(jù)的感知,數(shù)字化管理系統(tǒng)可以為醫(yī)院提供個性化的、符合醫(yī)院實際情況的管理方案。具體包括醫(yī)院績效、醫(yī)生管理、病案管理、醫(yī)院設(shè)備管理等等。

■ 醫(yī)療支付

隨著數(shù)字技術(shù)與醫(yī)療場景深度融合,新技術(shù)、新支付已成為擴大優(yōu)質(zhì)醫(yī)療服務(wù)供給的內(nèi)生動力,“醫(yī)療+藥(械)+保險”的創(chuàng)新融合正惠及越來越多的患者。醫(yī)療支付體系正在發(fā)生變革,除了支付中心向患者集中外,商業(yè)險、養(yǎng)老及護理險亦展現(xiàn)出潛力。

隨著參保群體的擴大和數(shù)據(jù)的豐富,醫(yī)療支付可能會出現(xiàn)幾個變化,首先可能是保險的差異化,根據(jù)不同的群體(患者、健康群體)推出險種的差異化,或者根據(jù)不同群體在同一險種推出差異化保費;其次可能是數(shù)據(jù)的價值創(chuàng)造,基于健康數(shù)據(jù)庫進行的個性化健康管理方案開發(fā),亦或者是理賠數(shù)據(jù)的精確計算。

這些場景中都可能會出現(xiàn)數(shù)字化的身影。數(shù)字化醫(yī)療一方面可以解決傳統(tǒng)醫(yī)療體系應(yīng)用中的難題,另一方面則是支付效率的提升。

■ 藥械企業(yè)創(chuàng)新

除了面向臨床和消費端,數(shù)字技術(shù)在產(chǎn)品端也大有可為。

首先是研發(fā)場景,如同數(shù)字化對醫(yī)院和支付體系的管理,數(shù)字技術(shù)同樣可以賦能藥物和醫(yī)療器械的研發(fā),通過數(shù)字化平臺可以對藥物研發(fā)流程進行管理。其次,通過數(shù)字化方案對臨床數(shù)據(jù)進行挖掘和生物信息分析,相比傳統(tǒng)分析手段更有效率,更有可能基于數(shù)據(jù)挖掘?qū)崿F(xiàn)“老藥新用”。

其次是生產(chǎn)環(huán)節(jié),可以利用機器視覺替代檢測人員,不僅減少了在整個生產(chǎn)環(huán)節(jié)的人工成本,更提升了檢測的準(zhǔn)確率與效率。此類應(yīng)用已經(jīng)在部分企業(yè)率先落地。經(jīng)過簡單模型與復(fù)雜特征的多重訓(xùn)練后,機器視覺與人工標(biāo)注的一致率已經(jīng)高達98.879%。

最后是流通環(huán)節(jié),數(shù)據(jù)仍然蘊含著大量亟待挖掘的價值。例如與某些疾病關(guān)聯(lián)的藥品,在需求上可能帶有明顯的地域集中性和時間周期性。因此,大量的AI算法應(yīng)運而生,藥物需求的預(yù)測正在成為可能。藥物和器械流通行業(yè)的參與者們也得以乘上數(shù)字化轉(zhuǎn)型的東風(fēng),通過邊緣實時的計算進行更精準(zhǔn)的預(yù)測,從而制訂更科學(xué)合理的藥物銷售與存儲策略。

■ 數(shù)字療法

借助數(shù)字技術(shù),還有一個曾經(jīng)被認為是未來愿景的場景正在逐漸成為現(xiàn)實--現(xiàn)在,我們已經(jīng)可以根據(jù)醫(yī)生的處方下載一款 APP 用于疾病治療。APP 也將成為一種藥物形式,或單獨存在,或與傳統(tǒng)藥物相結(jié)合,帶來更高效、更普及的治療方式。這也就是目前全行業(yè)高度關(guān)注的“數(shù)字療法 。

數(shù)字療法是一種向患者提供的、基于循證醫(yī)學(xué)證據(jù)的治療措施或干預(yù)措施。這些干預(yù)措施由高質(zhì)量的軟件程序驅(qū)動,其本質(zhì)是服務(wù)的數(shù)字化,核心功能則是用于預(yù)防、管理或治療某種疾病。它們可以單獨使用,也可以與藥物、設(shè)備或其他療法協(xié)同使用。

目前大多數(shù)數(shù)字療法圍繞精神類疾病、慢病、心理疾病等需要強干預(yù)的疾病展開。相比傳統(tǒng)療法,數(shù)字療法可以遠程進行問診或治療,也可以診斷患者的時間和物理空間進行個性化定制,此外在成本上也低于傳統(tǒng)療法。

當(dāng)然,數(shù)字技術(shù)的價值還遠不止于此,它不僅改變改變臨床與產(chǎn)品研發(fā),也在給患者和消費群體帶來更舒適的體驗。人們可以在家中通過網(wǎng)絡(luò)預(yù)約掛號;人們不再需要在檢查室等候檢查結(jié)果,各種診療影像和數(shù)據(jù)可以通過網(wǎng)絡(luò)直接傳送到主治醫(yī)生的面前,醫(yī)生可以及時、準(zhǔn)確地對病人做出診治?;诨ヂ?lián)網(wǎng)、有線電視等私人醫(yī)療保健服務(wù)和公眾醫(yī)療咨詢服務(wù),將隨時提醒大眾進行身體檢查、預(yù)測某種疾病的發(fā)生和發(fā)展,向病人推薦新的治療方法,使病人可以足不出戶享受個人醫(yī)生的醫(yī)療保健服務(wù)。當(dāng)下數(shù)字醫(yī)療已經(jīng)前景到一定高度,并獲得廣泛關(guān)注,但一切其實正在開始,未來或許還會有更多驚喜。

腦機接口

腦機接口,有時也稱作“大腦端口“或者“腦機融合感知”。這里的“腦”指有機生命形式的腦或者神經(jīng)系統(tǒng),“機”意指任何處理或計算的設(shè)備,其形式可以從簡單電路到硅芯片。

腦機接口技術(shù)被稱作是人腦與外界溝通交流的“信息高速公路”,是公認的新一代人機交互和人機混合智能的關(guān)鍵核心技術(shù)。除了頗具科幻概念的“意念控制”以外,腦機接口在醫(yī)療領(lǐng)域比較清晰的應(yīng)用方向是運動神經(jīng)康復(fù)和神經(jīng)疾病治療。不同于以往的外骨骼輔助產(chǎn)品,基于腦機接口的神經(jīng)修復(fù)是目前可見的、真正意義上的“控制恢復(fù)”。

■ 神經(jīng)調(diào)控

神經(jīng)調(diào)控是腦機接口信號閉環(huán)中向大腦寫入信號的過程,通過不同類別信號的刺激,可以改善和治療一些神經(jīng)系統(tǒng)的疾病狀態(tài)。當(dāng)前,基于電、聲、光、磁刺激神經(jīng)調(diào)控的腦機接口已經(jīng)實現(xiàn)商業(yè)化,從人工耳蝸,到腦深部電刺激再到經(jīng)顱磁刺激和近紅外功能成像,未來可以期待擴展到其他疾病的改善或治療。

■ 運動康復(fù)

腦機接口技術(shù)能夠?qū)崟r檢測患者腦電狀態(tài),通過訓(xùn)練調(diào)控大腦信號,影響皮質(zhì)活動,從而使患者鍛煉大腦神經(jīng),提高其功能性和連接性,實現(xiàn)了患者“意念控制”下的主被動協(xié)同康復(fù)訓(xùn)練。打破了傳統(tǒng)康復(fù)方式被動且單一的問題,實現(xiàn)患者意念控制下的主動康復(fù),顯著提升康復(fù)治療效果。

■ 神經(jīng)義肢

通過人工智能算法處理神經(jīng)-肌肉信號并結(jié)合內(nèi)置傳感器識別用戶意圖,實現(xiàn)“心隨手動”及走路跑步隨意切換的狀態(tài),可為殘障人士創(chuàng)造高品質(zhì)生活。目前這一類產(chǎn)品多為非侵入性產(chǎn)品。隨著技術(shù)的成熟與發(fā)展,集成式的植入性產(chǎn)品正在走向現(xiàn)實,這些產(chǎn)品主要面向漸凍癥、高位截癱等嚴重損傷疾病,或許隨著日后技術(shù)和監(jiān)管體系的成熟,侵入性腦機接口產(chǎn)品會帶來更多可能。

中國腦計劃以腦認知的神經(jīng)基礎(chǔ)為主體,以腦疾病的診治及腦機智能技術(shù)為兩翼開展底層布局,從認識腦、保護腦、模擬腦三個方面開展腦科學(xué)與類腦研究,形成“一體兩翼”的完善戰(zhàn)略布局。

國家“十四五”規(guī)劃部署五項研究重點領(lǐng)域,其中腦機融合納入重點技術(shù)研究范疇;2021年,我國正式啟動了百億級的科技創(chuàng)新2030重大項目“腦科學(xué)與類腦研究”,當(dāng)前中國腦計劃研究已進入實際落地階段。

目前的腦機接口產(chǎn)品主要是以非侵入性為主,具體原因可能與技術(shù)成熟度、監(jiān)管審批和適應(yīng)癥需求程度有關(guān)。此外,腦部植入性材料對生物相容性、穩(wěn)定性要求較高,這些植入材料和芯片、零部件的發(fā)展程度也密切關(guān)系腦機接口產(chǎn)業(yè)發(fā)展。

納米材料

納米技術(shù)是21世紀(jì)戰(zhàn)略技術(shù)的制高點,當(dāng)材料三維空間的某一結(jié)構(gòu)單元處于納米尺寸,其特性將發(fā)生改變。這一類材料被叫做納米材料。由于它的尺寸已經(jīng)接近電子的相干長度,它的性質(zhì)因為強相干所帶來的自組織使得性質(zhì)發(fā)生很大變化。并且,其尺度已接近光的波長,加上其具有大表面的特殊效應(yīng),因此其所表現(xiàn)的特性,例如熔點、磁性、光學(xué)、導(dǎo)熱、導(dǎo)電特性等等,往往不同于該物質(zhì)在整體狀態(tài)時所表現(xiàn)的性質(zhì)。

納米材料與醫(yī)療的應(yīng)用被總結(jié)為米生物與醫(yī)學(xué)研究,這里面出了包含相關(guān)的材料特性和表征技術(shù),以及基于這些展開的對生命過程的檢測和調(diào)控研究,是納米科學(xué)領(lǐng)域的重要組成部分。具體而言,納米材料有醫(yī)學(xué)的應(yīng)用可以分為以下幾個方面。

■ 藥物遞送和納米藥物

其實早在20世紀(jì)60年代,人們發(fā)現(xiàn)有些納米材料作為載體,能輕松地跨越許多生物障礙。于是,納米材料就在藥物遞送方向得以應(yīng)用。1965年英國科學(xué)家Bangham發(fā)現(xiàn)脂質(zhì)體的時候,就開始涉及納米藥物載體。國內(nèi)藥劑學(xué)界也很早把納米給藥系統(tǒng)介紹到國內(nèi),并開始研究。

納米材料在藥物遞送方面的研究也有多個路徑,如通過脂質(zhì)體攜帶藥物、通過聚合物膠束,通過納米機器人或者自組織的藥物系統(tǒng)自組裝藥物。

納米藥物是用納米生物技術(shù)將藥物等生物活性分子與載體材料相復(fù)合,進而利用納米效應(yīng)改變所載活性成分藥代動力學(xué)、藥效及藥理學(xué)等方面的性質(zhì)而獲得顯著臨床優(yōu)勢的納米組裝體。所攜帶的成分可以是烷化劑、抗代謝類藥物等小分子化合物,也可以是多肽、蛋白質(zhì)、核酸藥物等大分子或造影劑。

最早,納米材料在藥物遞送過程中發(fā)揮的主要作用是運輸、緩釋等,如今則更專注在靶向性和大分子藥物的傳輸上。不過,在科研界已經(jīng)有發(fā)現(xiàn)既能夠載藥,又能夠治療的納米粒子,納米藥物的未來,很難以現(xiàn)在的眼光來定義。

■ 再生醫(yī)學(xué)

納米再生醫(yī)學(xué)是2018年公布的生物物理學(xué)名詞,指利用納米材料與技術(shù)模仿人體或動物組織或器官的微觀結(jié)構(gòu),研究其替換或誘導(dǎo)組織或器官的再生、重建或恢復(fù)其正常功能的學(xué)科。

再生醫(yī)學(xué)主要有細胞技術(shù)再生、材料再生,以及細胞和材料結(jié)合的再生研究?;诓牧系脑偕芯渴峭ㄟ^具備組織誘導(dǎo)特性的材料來實現(xiàn)的。通過將體外大量擴增得到的細胞種植在組織誘導(dǎo)材料的多孔支架上,將細胞在體外或體內(nèi)進行培養(yǎng)。隨后,生物基質(zhì)會在細胞生長完成后進行降解,最終重新得到活細胞、器官或者類器官。在材料相關(guān)的再生研究方向,納米材料具有絕對的領(lǐng)導(dǎo)地位。

■ 醫(yī)療器械

作為發(fā)展的基礎(chǔ),材料在醫(yī)療領(lǐng)域應(yīng)用非常廣泛,小到紗布、注射器,大到儀器設(shè)備,替換的人體組織和器官。材料在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用幾乎涉及到了方方面面。

在醫(yī)療器械領(lǐng)域,從工程化基礎(chǔ)到植入性材料,再到生物傳感器、探針,納米材料的身影隨處可見。如通過在納米粒子上連接抗體,對目標(biāo)分子進行定向診斷,如運用納米技術(shù)制備或構(gòu)建的含有納米顆粒的顯像載體,用于增強醫(yī)學(xué)成像反差等?;诩{米材料開發(fā)的分子診斷、生物成像技術(shù),以及熒光、生化檢測技術(shù)在疾病的早期診斷方面展現(xiàn)出前景。

納米材料生物醫(yī)藥、能源、化工催化等各個行業(yè)和領(lǐng)域均展現(xiàn)出卓越能力,也被全球多個國家和一眾科研機構(gòu)的重視。美國在2000年通過了《國家納米計劃》,將“納米科學(xué)、納米材料、材料與新的生產(chǎn)技術(shù)”作為優(yōu)先發(fā)展領(lǐng)域。

中國在“八五”期間也將“納米材料科技”列入了國家攀登項目,并在2001年發(fā)布了《國家納米科技發(fā)展綱要》;“十三五”期間還成立了國家納米科學(xué)中心、國家納米技術(shù)產(chǎn)業(yè)化基地、以及納米技術(shù)及應(yīng)用國家工程研究中心來推動基礎(chǔ)研究和應(yīng)用研究,以及產(chǎn)業(yè)化。

中科院體系和各個高校相關(guān)的納米科技研究平臺超過70個。無論是從戰(zhàn)略導(dǎo)向、產(chǎn)業(yè)需求和導(dǎo)向和研究熱度來看,納米材料都有可能是生物醫(yī)學(xué)材料領(lǐng)域最值得關(guān)注的領(lǐng)域,或許沒有之一。

分子遺傳學(xué)

測序技術(shù)的大規(guī)模應(yīng)用將現(xiàn)代醫(yī)學(xué)帶入了精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)時代。或者更貼切的說,是分子層面、遺傳學(xué)層面?;谶z傳學(xué)的驅(qū)動,現(xiàn)有的診療方案研發(fā)有了完全不同的思路,細胞治療、基因治療、免疫治療等過去看似遙不可及的治療方案走進現(xiàn)實。

分子遺傳學(xué)在近些年也被人熟知,或者說它已經(jīng)成為現(xiàn)實中的技術(shù),或許把它放在未來暢想中有些突兀。但之所以做這樣的決定,是因為現(xiàn)在所取代的成就還只是短短的一小段路程。如同人們對基因位點知之甚少,分子遺傳學(xué)的探索還有很長的路要走。當(dāng)然,這些探索更多可能是在單細胞層面、具體的基因位點表達層面等。

■ 表觀遺傳與基因組

DNA測序在過去十年中繼續(xù)占據(jù)主導(dǎo)地位,以指數(shù)增長的全基因組圖譜展示了所有層次(DNA、RNA和組蛋白)的調(diào)控。無論是轉(zhuǎn)錄組、組蛋白修飾、還是轉(zhuǎn)錄因子,科研界都做了大量研究,也積累了前所未有的數(shù)據(jù)。這些圖譜正在更好的向人們?nèi)腔蚺c表達的關(guān)系,對關(guān)的表觀遺傳學(xué)甲基化酶、閱讀蛋白、去甲基化酶等相關(guān)蛋白的作用和機理也有了更多的認知。大量的集成和多層表觀基因組分析提供了相當(dāng)全面的表觀基因組的圖譜景觀,包括它們在發(fā)育和疾病中的動態(tài)。但仍然有很多未解之謎。比如胞嘧啶甲基化的精確功能,比如脊椎動物和無脊椎動物的甲基化分別如何發(fā)生,比如發(fā)育中的敲除突變體胚胎為何死亡等等。

在大多數(shù)情況下表觀基因組的分析發(fā)展成為對許多表觀遺傳層面的極有價值、但仍處于描述性階段的理解。但還有許多問題,需要未來給出答案。

■ 基因、基因表達和疾病

Francis Collins曾言,除外傷以外,人類的各種疾病基本可以表達為遺傳因素(內(nèi)因)與環(huán)境因素(外因)共同作用的結(jié)果。無論是細胞治療還是免疫治療,藥物和治療方案研究的邏輯越發(fā)回歸到遺傳分子本身和基因、蛋白質(zhì)層面?,F(xiàn)如今的諸多突破性治療方案也是從遺傳或者疾病發(fā)病機制層面出發(fā)。在遺傳和基因、蛋白質(zhì)表達檢測工具越發(fā)成熟的情況下,臨床診療方式有望被徹底改變。

然而如前文所說,從DNA到轉(zhuǎn)錄,到蛋白質(zhì),再到表型,人們?nèi)耘f知之甚少。因此,即便關(guān)于疾病與基因的研究由來已久,但這依舊會是未來的時代主題。

mRNA與生物醫(yī)藥

核酸藥物被譽為生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)但第三次革命,2017年前后,mRNA療法成為核酸藥物中明星。

mRNA即信使RNA,是由DNA的一條鏈作為模板轉(zhuǎn)錄而來的、攜帶遺傳信息能指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成的一類單鏈核糖核酸,在蛋白編碼過程中發(fā)揮著重要作用。簡單來說,mRNA由DNA轉(zhuǎn)錄得到,直接指導(dǎo)蛋白質(zhì)翻譯,是行使生命活動的直接指令單元,而蛋白質(zhì)是行使生命活動功能的主要單元。因此,基于蛋白翻譯的中心法則,mRNA相關(guān)的藥物、疫苗、生物療法在近些年成為熱點。

■ 蛋白替換療法

而伴隨著mRNA的修飾、遞送等技術(shù)的發(fā)展,基于mRNA的蛋白質(zhì)替代治療應(yīng)運而生。

蛋白質(zhì)替代治療即引入治療性抗體和功能蛋白,通過注射mRNA轉(zhuǎn)染至體細胞后翻譯出蛋白質(zhì),以替換異常蛋白質(zhì)或作為缺乏蛋白質(zhì)的補充,目前已在遺傳性代謝疾病、實體瘤、心血管疾病等領(lǐng)域得到初步應(yīng)用。相較于其他應(yīng)用,mRNA蛋白替代療法研發(fā)還尚在早期探索中,但根據(jù)現(xiàn)有臨床結(jié)果顯示其應(yīng)用潛力巨大,已初步驗證了其安全性以及療效。

■ 腫瘤免疫

人工合成的mRNA能夠為任何蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)片段或肽的合成提供模板,在藥物研究中有著諸多應(yīng)用,腫瘤免疫也是其中之一。

我們可以將mRNA癌癥疫苗視為一段人工合成mRNA。在注射mRNA癌癥疫苗后,mRNA編碼的蛋白質(zhì)由核糖體合成,然后翻譯后修飾以產(chǎn)生正確折疊的功能蛋白質(zhì),并呈現(xiàn)給免疫系統(tǒng)。該過程類似于RNA病毒感染和連續(xù)誘導(dǎo)保護性免疫反應(yīng)的自然過程。理論上mRNA癌癥疫苗可以編碼任何蛋白質(zhì),也可以通過編碼出特定蛋白影響腫瘤免疫微環(huán)境,克服腫瘤免疫耐受。這已成為mRNA腫瘤疫苗研究的一個重要方向。如BioNTech就將新一代CAR-T療法與mRNA疫苗聯(lián)合,用于實體瘤治療研究。

■ 疫苗

如上文所講,人工合成mRNA可以編碼任意蛋白,可以產(chǎn)生靶標(biāo)蛋白或免疫原,激活體內(nèi)免疫反應(yīng),以對抗各種病原體。并且,這一類疫苗在安全性、生產(chǎn)成本上也具備優(yōu)勢。mRNA疫苗利用的是病毒的基因序列而不是病毒本身,不帶有病毒成分,沒有感染風(fēng)險;生產(chǎn)上,mRNA不需要佐計,易于批量生產(chǎn)、成本低。

全球領(lǐng)域有無數(shù)家mRNA疫苗公司,其中最受矚目當(dāng)屬BioNTech、Moderna、CureVac。這些公司當(dāng)產(chǎn)品管線大多圍繞腫瘤展開。不過,相比傳統(tǒng)疫苗8-14年的研發(fā)周期,mRNA疫苗的研發(fā)周期明顯更短,或許除了腫瘤以外,mRNA疫苗在更多疾病和傳染病預(yù)防等場景還有更多可能。

實驗室智慧化

智慧化建設(shè)在傳統(tǒng)工業(yè)領(lǐng)域已經(jīng)有較為成熟的運用,例如食品、汽車生產(chǎn)等領(lǐng)域通過全自動流水線建設(shè),部分替代,甚至某些領(lǐng)域?qū)崿F(xiàn)全面代替人工。近年來,醫(yī)療和科研領(lǐng)域的實驗室也意識到了智慧化建設(shè)的作用,例如通過自動化設(shè)備或流水線建設(shè)替代重復(fù)性高的機械性人工操作、通過信息化建設(shè)將實驗室信息數(shù)據(jù)化從而避免人工記錄錯誤、通過數(shù)字化建設(shè)幫助實驗更高效運營等。在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域包括臨床檢驗檢測、藥物研發(fā)、生物實驗等多類型實驗室也開始嘗試通過自動化、信息化及數(shù)字化的建設(shè)讓實驗室從多維度“智慧”起來,這類實驗室,我們稱之為智慧醫(yī)學(xué)實驗室。

■ 藥物研發(fā)

藥物的構(gòu)效關(guān)系是指藥物的化學(xué)活性與藥效的關(guān)系。傳統(tǒng)的構(gòu)效關(guān)系研究以定性研究為主,現(xiàn)實對物質(zhì)結(jié)構(gòu)與活性的關(guān)系進行推測,再確定靶酶活性位點的結(jié)構(gòu)并設(shè)計。在自動化場景中,計算機為輔助工具的定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR)方法成為合理藥物設(shè)計的重要方法之一。

在藥物設(shè)計環(huán)節(jié),靶蛋白 3D 結(jié)構(gòu)對于基于結(jié)構(gòu)的藥物發(fā)現(xiàn)至關(guān)重要,人工智能與自動化工具已經(jīng)初見成效,如 AlphaFold 在對目標(biāo)蛋白質(zhì) 3D 結(jié)構(gòu)的預(yù)測已經(jīng)相當(dāng)精準(zhǔn)。而人工智能與冷凍電鏡這種組合,也讓藥物研發(fā)的效率和精度實現(xiàn)某種程度上的雙向提升。

■ 樣本管理

智慧化的樣本培養(yǎng)和存儲,以及樣本管理能夠讓實驗室的樣本管理更有效、有序和安全。比如,通過精準(zhǔn)控制樣本的溫度、適度,對樣本進行妥善保存,避免因認為因素造成的樣本損失。比如基于機器人、AI 和自動化等技術(shù)的全流程樣本植被,能夠在節(jié)省人力的同時使得同一制備條件的樣本真正保持同一標(biāo)準(zhǔn)和質(zhì)量,在多類實驗并行制樣以及同一樣本并行實施多類實驗前處理,保證了樣本的一致性從而讓產(chǎn)出的數(shù)據(jù)真實、可靠等。

■ 數(shù)據(jù)分析和管理

實驗環(huán)節(jié)中,數(shù)據(jù)下機只是第一步,通常需要經(jīng)過漫長而精細的數(shù)據(jù)分析處理才能反映出某一階段的結(jié)果。當(dāng)然,這里的“數(shù)據(jù)”可能是真正的數(shù)據(jù),也可能是圖片和實驗人員記錄下來的文字。尤其是研究型實驗室,數(shù)據(jù)的維度和處理需求越是復(fù)雜,除了數(shù)據(jù)的模塊化以外,還涉及大量的計算。不僅如此,數(shù)據(jù)的存儲、調(diào)用和查詢通常也是復(fù)雜的工作?;谥腔刍膶嶒灁?shù)據(jù)管理,能夠?qū)崿F(xiàn)安全、有效、有序的存儲,對實驗效率提升作用明顯。

智慧化實驗室的應(yīng)用還有很多,或者說這其實是一個開放性的“選題”,其應(yīng)用場景取決于實驗室降本增效的需求。相比本文中的其他技術(shù),自動化實驗室其實是一個基于多種技術(shù)形成的產(chǎn)品,或許其底層技術(shù)來自科研端,但其應(yīng)用和產(chǎn)品化更多時候可能是商業(yè)化公司推動。

AI與空間組學(xué)

空間組學(xué)(Spatial omics)作為《Nature》2022值得年度關(guān)注的七大榜單技術(shù),被譽為“生命科學(xué)”的下一個風(fēng)口。

蛋白質(zhì)是所有細胞的功能性分子,并且是所有生物過程的效應(yīng)產(chǎn)物。蛋白質(zhì)的空間表達對于確定蛋白質(zhì)在組織中的準(zhǔn)確定位和功能至關(guān)重要,其可隨著細胞類型、細胞周期進展、疾病狀態(tài)和診療方法的變化而改變。因此,空間蛋白質(zhì)組學(xué)可以用來研究疾病相關(guān)的蛋白質(zhì)空間表達譜變化,為尋找生物標(biāo)志物和開發(fā)新的診療方法提供全新的視角。近年來,空間蛋白質(zhì)組學(xué)研究在微環(huán)境與疾病發(fā)展、機制與藥物靶點、器官結(jié)構(gòu)異質(zhì)性和組織器官空間圖譜等方面取得了突出的進展。

■ 腫瘤微環(huán)境研究

空間蛋白質(zhì)組學(xué)開辟了解析組織微環(huán)境、組織生物標(biāo)記物開發(fā)、疾病診斷與預(yù)后、以及精準(zhǔn)醫(yī)療等領(lǐng)域全新的研究視角,也有望將臨床診斷往疾病本質(zhì)更進一步。

空間蛋白組學(xué)在臨床診斷的突破性之一在與對細胞微環(huán)境的檢測。在臨床研究中,目前空間蛋白組學(xué)更多的方向是對腫瘤微環(huán)境的應(yīng)用研究。

癌癥微環(huán)境類似于一個生態(tài)系統(tǒng),是一個具有不同細胞群體和物種的混合物。例如,物種豐富度(也可以指腫瘤內(nèi)的異質(zhì)性)可能與免疫治療的穩(wěn)定性和患者的長期預(yù)后有關(guān)。免疫細胞和癌細胞之間的代謝競爭,可以稱為種間競爭,也是癌癥進展的關(guān)鍵決定因素。

通過提供系統(tǒng)層面的細胞和分子圖譜的精確空間坐標(biāo),空間組學(xué)正在改變我們對癌癥環(huán)境的理解。比如《Nature Biotechnology》上一篇名為“Deep Visual Proteomics defines single-cell identity and heterogeneity”的文章,研究人員就通過獲取空間多組學(xué)圖譜可以以整體方式重建腫瘤發(fā)生的關(guān)鍵過程。

空間蛋白組技術(shù)能區(qū)別具有特異性表型的細胞,并借助蛋白組學(xué)分析該細胞的潛在功能。在黑色素瘤組織中精確分析出僅在腫瘤區(qū)域中出現(xiàn)的與免疫調(diào)控和DNA復(fù)制相關(guān)的特征性蛋白。這使得跨二維組織切片的癌癥進展的失調(diào)關(guān)鍵途徑的可視化成為可能。

■ 疾病機制與藥物發(fā)現(xiàn)

空間蛋白質(zhì)組學(xué)直接從其天然組織環(huán)境中比較和對比單一的細胞類型和狀態(tài),可獲取到蛋白組對應(yīng)的細胞類型與空間信息,能夠找到更精準(zhǔn)的疾病關(guān)鍵靶標(biāo)蛋白及診治生物標(biāo)志物。如Nature正刊發(fā)表的題為“Proteomics reveals NNMT as a master metabolic regulator of cancer-associated fibroblasts”的文章,針對卵巢癌以及卵巢癌附近基質(zhì)開展空間蛋白質(zhì)組學(xué)分析,成功揭示了NNMT作為基質(zhì)細胞對腫瘤轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵調(diào)控靶點,也為未來有針對的卵巢癌轉(zhuǎn)移靶向治療提供了新的思路。

一些研究者也已成功運用空間蛋白質(zhì)組學(xué)來研究疾病,包括急性病毒感染和肝病,或闡明單基因疾病背后的細胞缺陷。目前已經(jīng)達到了空間蛋白質(zhì)組學(xué)最終與其他“組學(xué)”技術(shù)、細胞生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究相結(jié)合的地步,從而為生物過程提供無偏見的系統(tǒng)層面的見解。目前可用的空間蛋白質(zhì)組學(xué)方法是高度互補的,它們各自的發(fā)展優(yōu)勢和局限性使它們適合于不同類型的應(yīng)用。

超分辨率顯微成像

自列文虎克發(fā)明第一臺顯微鏡以來,人們變開始了對微觀世界的探索和觀察。在微觀世界的研究歷史中,光學(xué)顯微鏡功不可沒?;诠鈱W(xué)顯微鏡,人們第一次看到了細胞、發(fā)現(xiàn)了微生物。

然而,隨著微觀的研究從微觀世界深入到微觀結(jié)構(gòu),光學(xué)顯微鏡的局限也因此出現(xiàn)。光學(xué)顯微鏡受制于光學(xué)衍射極限,無法對極限值以外的分子和結(jié)構(gòu)進行觀察。盡管隨后也誕生了掃描電鏡等納米級別分辨率的顯微鏡,但在實際應(yīng)用中或多或少都存在一些缺陷。

2006年是超分辨率纖維成效技術(shù)的問世之年。美國科學(xué)家Eric Betzig等首次在期刊Science上提出了光激活定位顯微技術(shù)(PALM)的概念,讓人類能以精確視角窺探到小于衍射極限的納米級微觀世界光學(xué)圖像。他也因此獲得2014年諾貝爾化學(xué)獎。

同樣是2006年,哈佛大學(xué)莊小威團隊成功開發(fā)隨機光學(xué)重建顯微技術(shù)(STORM)。由于省去了光漂白步驟,相較于PALM,STORM在快速數(shù)據(jù)采集上更有優(yōu)勢。

不同與其他超分辨觀測,可進行活細胞觀測。因此,超分辨率成像技術(shù)的應(yīng)用主要幾種在生物學(xué)、農(nóng)學(xué)、畜牧、獸醫(yī)科學(xué)領(lǐng)域。

■ 活細胞相關(guān)的研究

當(dāng)觀測的分辨率能夠微觀到亞細胞結(jié)構(gòu),生物學(xué)研究或許將被重新定義。

在比如骨細胞研究。骨折修復(fù)與成骨細胞和破骨細胞有關(guān)。骨骼中發(fā)現(xiàn)的成骨細胞和破骨細胞都與骨折的修復(fù)有關(guān),成骨細胞和破骨細胞之間的主要區(qū)別在于,成骨細胞與骨骼的形成和礦化有關(guān),而破骨細胞與骨骼的分解和吸收有關(guān)。通過結(jié)合基因編輯和超分辨率成像技術(shù),可以觀察和研究敲除不同基因位點對蛋白表達和細胞表達之間的關(guān)系,從而有望尋找到利于骨骼修復(fù)的表達機制和治療方案。

不僅如此,亞細胞結(jié)構(gòu)細節(jié)的可視化,同樣意味著蛋白質(zhì)定位和功能研究的工具取得突破,能夠在單分子水平上直接觀察到這些目標(biāo)分子的動態(tài)特征。以神經(jīng)科學(xué)為例。大腦是復(fù)雜的神經(jīng)元網(wǎng)絡(luò),人類大腦包含超過800億個神經(jīng)元,每個神經(jīng)元由數(shù)千個突觸連接。由于衍射極限的尺寸限制,熒光顯微成像技術(shù)無法觀測到神經(jīng)突觸信號傳遞等現(xiàn)象。而超分辨率成像技術(shù)則使得這一切成為可能。如果通過成像技術(shù)觀測神經(jīng)突觸之間的遞質(zhì)運輸、釋放,蛋白質(zhì)的折疊,或許人們對神經(jīng)系統(tǒng)以及神經(jīng)系統(tǒng)疾病的理解將出現(xiàn)質(zhì)的飛躍。

■ 細胞器功能及活動研究

盡管光學(xué)顯微鏡和電子顯微鏡已經(jīng)能看到包括線粒體、葉綠體在內(nèi)的多個細胞器,但這些細胞器是如何活動和發(fā)揮功能的,前兩類顯微鏡就顯得無能為力。超分辨率成像技術(shù)的突破,也使得對于細胞器功能和活動的研究取得了多項新的突破。比如細胞內(nèi)脂肪的存儲和代謝、線粒體與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的互作如何影響線粒體的分裂與融合。這些在“細胞工場”內(nèi)進行的活動可能與骨骼肌、心臟等器官和組織的代謝有關(guān),異常的代謝可能導(dǎo)致某些疾病。對細胞器功能和活動研究的深入,也許會帶來對某些代謝性疾病研究的新思路。

■ 核酸成像

DNA、RNA是多種基本生物學(xué)過程的關(guān)鍵,其能傳遞遺傳信息,將其轉(zhuǎn)化為蛋白質(zhì)或支持基因調(diào)控。為了“看見”遺傳分子,人們做出了許多努力,目前最成功的的要數(shù)測序技術(shù)。但測序技術(shù)的本質(zhì)其實是檢測、計算與統(tǒng)計,即便準(zhǔn)確性已經(jīng)非常高,但我們依然不能認為其結(jié)果是絕對的。另一方面,測序技術(shù)需要經(jīng)歷核酸分子的打碎和重新組裝,無法對活細胞的遺傳物質(zhì)進行解析。

超分辨率成像技術(shù)的出現(xiàn),使得活細胞的核酸成像達到了前所未有的分辨率。如哈佛大學(xué)莊小威教授的研究,她與團隊圍繞顯微技術(shù)攻關(guān)開發(fā)了多項技術(shù),包括但不限于單分子動力學(xué)、核酸與蛋白的相互作用、基因表達機制、細胞核病毒的相互作用等。其中在核酸成像,其團隊首次揭示了人類染色體的三位結(jié)構(gòu),開拓了檢測DNA與蛋白質(zhì)相互作用的新技術(shù),構(gòu)建了下丘腦視前區(qū)的細胞空間圖譜.......她和團隊在單分子動力學(xué)、核酸與蛋白的相互作用、基因表達機制、細胞核病毒的相互作用等領(lǐng)域做出了杰出的貢獻。

此外,莊小威教授還和David R.Walt教授等人成立了開發(fā)下一代空間解析單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)的生物醫(yī)藥公司Vizgen,將利用超分辨率成像技術(shù)突破空間分辨單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)的界限,對健康和病理組織的分子和細胞組織做進一步的研究。

總的來說,超分辨率成像技術(shù)是活細胞層面的研究利器,基于這一技術(shù),人們有望一窺生物學(xué)的更多秘密。

結(jié)語

以上是橙果局基于產(chǎn)業(yè)觀察、訪談,以及前沿科研動態(tài)總結(jié)的2023年“十大前沿創(chuàng)新”?;蛟S由于我們淺薄的認知和粗淺知識,“猜想”名單中不免會有信息不正確、疏漏,或者描述不當(dāng)?shù)牡胤?,我們期待并感謝您的指正。同樣重要的是,科技創(chuàng)新是星辰大海,我們目之所及,恐怕連冰山一角都不到。如果關(guān)于未來科技,如果您有不同都看法和猜想,歡迎留言分享。

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